More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0611 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  100 
 
 
462 aa  898    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  60.67 
 
 
451 aa  528  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  58.56 
 
 
455 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  46.15 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  46.33 
 
 
446 aa  355  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  44.13 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  44.97 
 
 
452 aa  353  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  43.81 
 
 
452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  44.49 
 
 
452 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  44.75 
 
 
452 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  44.66 
 
 
452 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  44.66 
 
 
452 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  44.66 
 
 
452 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  43.79 
 
 
452 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  46.02 
 
 
450 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  43.68 
 
 
452 aa  346  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  43.14 
 
 
452 aa  339  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  45.51 
 
 
452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  43.82 
 
 
452 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  45.09 
 
 
452 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  45.09 
 
 
452 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  45.31 
 
 
455 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  42.12 
 
 
461 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  44.97 
 
 
450 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  42.89 
 
 
447 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  40.48 
 
 
452 aa  323  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  44.95 
 
 
446 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  47.96 
 
 
447 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  43.59 
 
 
447 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  41.27 
 
 
452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  40 
 
 
453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  40.09 
 
 
455 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  38.01 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  37.1 
 
 
460 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  35.4 
 
 
444 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  35.31 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  32.56 
 
 
461 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  35.15 
 
 
444 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  33.64 
 
 
462 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  32.26 
 
 
498 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  32.03 
 
 
498 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  32.03 
 
 
498 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  32.03 
 
 
498 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  32.03 
 
 
498 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  31.99 
 
 
468 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  31.57 
 
 
477 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  34.15 
 
 
464 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  30.66 
 
 
477 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  30.66 
 
 
477 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  33.78 
 
 
456 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  30.66 
 
 
477 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  34.17 
 
 
485 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  32.54 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  32.54 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  33.48 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  32.54 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  32.54 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  29.87 
 
 
448 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  33.26 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  33.6 
 
 
487 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  29.73 
 
 
476 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  32.81 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  29.91 
 
 
488 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  33.49 
 
 
490 aa  179  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  30.85 
 
 
458 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  31.21 
 
 
494 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  29.41 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  29.77 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  30.51 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  30.72 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  30.02 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  30.8 
 
 
452 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  29.28 
 
 
444 aa  173  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  30.37 
 
 
452 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  30.5 
 
 
458 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  32.33 
 
 
464 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  30.02 
 
 
474 aa  170  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  30.94 
 
 
485 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  27.58 
 
 
453 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  28.88 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  32.1 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  30.33 
 
 
485 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  29.62 
 
 
449 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  31.02 
 
 
452 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  29.56 
 
 
450 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  26.61 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  26.61 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  31.61 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  29.07 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  29.59 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  27.13 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  29.93 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  28.82 
 
 
450 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  28.54 
 
 
453 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  29.93 
 
 
441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  30.18 
 
 
441 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  29.18 
 
 
453 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  30.18 
 
 
441 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  29.62 
 
 
441 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  29.62 
 
 
441 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>