204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3624 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  100 
 
 		 434 aa  837    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  65.53 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  60.71 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  47.88 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  47.64 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  47.51 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  47.03 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  47.03 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  45.84 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  45.84 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  47.74 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  45.69 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  45.69 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  45.69 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  45.69 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  43.38 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  30.94 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  28.11 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  28.11 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  28.11 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  28.11 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  28.11 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  23.1 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  23.1 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  24.71 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  26.12 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  25 
 
 		 450 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  22.6 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  28.64 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2450  permease DsdX  24.5 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  23.71 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  29.19 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  24.48 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0693  fructuronate transporter  24.48 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  22.73 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  24.27 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  30.2 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  27.59 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  24.86 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  24.51 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  24.51 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  28.66 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  23.19 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  26.46 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  24.5 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  23.19 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  26.01 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  23.19 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  27.37 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  26.01 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  26.01 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  24.47 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  26.01 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  24.51 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  24.51 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.47 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.47 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.47 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.47 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  25.38 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  24.51 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  25.56 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  27.59 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  25.56 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  25.46 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  30.13 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  30.13 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  32.19 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  24.47 
 
 		 452 aa  57  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  30.13 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  30.13 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  25.56 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  24.17 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.17 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  30.13 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  24.32 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  24.29 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  24.29 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  24.29 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  29.46 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  24.29 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  24.29 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  24.29 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  29.08 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  25.56 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  23.02 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  29.71 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  26.09 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  26.67 
 
 		 460 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  24.5 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  22.41 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  22.41 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  24.6 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  23.7 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  23.7 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  23.7 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  22.52 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  26.26 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  26.5 
 
 		 485 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  25.96 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>