More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1596 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  100 
 
 		 453 aa  874    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  58.73 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  60.86 
 
 		 455 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  57.92 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  58.28 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  56.79 
 
 		 452 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  56.44 
 
 		 452 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  54.97 
 
 		 452 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  54.29 
 
 		 452 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  56.67 
 
 		 452 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  58.06 
 
 		 452 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  58.19 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  58.19 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  58.19 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  58.01 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  56.64 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  56.98 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  57.05 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  58.96 
 
 		 450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  57.84 
 
 		 452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  57.84 
 
 		 452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  57.87 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  51.68 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  53.24 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  48.78 
 
 		 447 aa  372  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  47.15 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  45.37 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  46.8 
 
 		 447 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  41.88 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  40.47 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  42.47 
 
 		 451 aa  316  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  43.12 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  39.95 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  40.53 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  37.69 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  39.42 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  38.31 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  36.9 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  35.96 
 
 		 482 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  37.56 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  37.56 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  37.56 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  37.56 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  37.56 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  35.18 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  35.54 
 
 		 468 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  35.12 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  35.39 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  35.08 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  34.69 
 
 		 487 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  32.8 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  33.26 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  33.77 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  36.41 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  34.74 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  33.63 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  33.84 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  34.47 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  33.55 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  33.55 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  33.55 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  33.62 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  33.55 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  33.62 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  33.55 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  33.62 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  31.45 
 
 		 447 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  31.45 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  34.35 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.06 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  31.45 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  31.22 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  37 
 
 		 490 aa  190  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2450  permease DsdX  32.96 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  31.71 
 
 		 485 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  31.5 
 
 		 485 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  33.18 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  32.29 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  32.71 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  33.71 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  31.29 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  32 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  33.26 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  32.24 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  29.95 
 
 		 444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  32.82 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  32.35 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  31.81 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  31.81 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  31 
 
 		 449 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  32.35 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  32.35 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  32.35 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  31 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  32.35 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  32.35 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  31.76 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  29.28 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  30.79 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  32.82 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>