More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0790 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  100 
 
 
452 aa  880    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  42.09 
 
 
447 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  43.82 
 
 
447 aa  334  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  42.86 
 
 
446 aa  308  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  39.55 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  40.39 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  39.44 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  39.18 
 
 
446 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  38.23 
 
 
452 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  39.51 
 
 
452 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  38.7 
 
 
452 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  40 
 
 
452 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  40 
 
 
452 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  39.78 
 
 
452 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  40 
 
 
452 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  40 
 
 
452 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  38.62 
 
 
452 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  38.82 
 
 
461 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  36.78 
 
 
460 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  38.86 
 
 
452 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  39.69 
 
 
452 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  37.58 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  40.09 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  39.82 
 
 
450 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  39.56 
 
 
452 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  39.56 
 
 
452 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  39.56 
 
 
452 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  38.53 
 
 
453 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  39.68 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  37.8 
 
 
452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  39.24 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  40.26 
 
 
447 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  36.82 
 
 
455 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  41.07 
 
 
461 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  35.31 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  37.59 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  35.93 
 
 
485 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  35.7 
 
 
462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  35.36 
 
 
444 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  36.34 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  36.32 
 
 
498 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  36.32 
 
 
498 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  36.32 
 
 
498 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  36.32 
 
 
498 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  36.32 
 
 
498 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  33.55 
 
 
468 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  34.06 
 
 
444 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  34 
 
 
482 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  37.24 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  36.26 
 
 
494 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  30.96 
 
 
450 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  30.96 
 
 
450 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  32.42 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  30.73 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  31.18 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  30.96 
 
 
450 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  33.1 
 
 
448 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  33.11 
 
 
445 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  29.15 
 
 
453 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  31.47 
 
 
450 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  32.89 
 
 
445 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  32.89 
 
 
445 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  32.89 
 
 
445 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  32.45 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  32.23 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  32.6 
 
 
445 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  32.53 
 
 
446 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  30.18 
 
 
450 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  30.24 
 
 
450 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  33.26 
 
 
449 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  30.51 
 
 
441 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  34.24 
 
 
449 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  33.03 
 
 
449 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  31.79 
 
 
445 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  31.79 
 
 
445 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  30.89 
 
 
441 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  31.79 
 
 
445 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  31.79 
 
 
445 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  31.79 
 
 
445 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  30.51 
 
 
441 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  30.07 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  31.33 
 
 
441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  30.29 
 
 
441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  30.3 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  30.32 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  34.24 
 
 
449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  28.83 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  30.68 
 
 
445 aa  183  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  30.29 
 
 
441 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  30.29 
 
 
441 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  31.18 
 
 
450 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  29.19 
 
 
447 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  28.86 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  31.64 
 
 
450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  28.96 
 
 
447 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  29.25 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  30.28 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  28.96 
 
 
447 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  30.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  30.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>