More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2641 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  86.5 
 
 		 452 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  86.28 
 
 		 452 aa  744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  85.4 
 
 		 452 aa  747    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  78.59 
 
 		 450 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  86.95 
 
 		 452 aa  754    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  86.5 
 
 		 452 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  86.28 
 
 		 452 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  86.28 
 
 		 452 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  100 
 
 		 452 aa  885    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  86.06 
 
 		 452 aa  755    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  88.89 
 
 		 452 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  86.28 
 
 		 452 aa  752    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  86.06 
 
 		 452 aa  710    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  86.5 
 
 		 452 aa  743    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  88.01 
 
 		 452 aa  753    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  77.32 
 
 		 450 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  71.4 
 
 		 452 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  72.91 
 
 		 455 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  70.91 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  66.52 
 
 		 452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  67.63 
 
 		 452 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  60.68 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  56.4 
 
 		 455 aa  458  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  56.98 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  49.78 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  52.12 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  54.55 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  48.72 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  47.96 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  46.15 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  45.8 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  44.02 
 
 		 455 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  42.95 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  43.89 
 
 		 460 aa  336  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  40.99 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  37.75 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  38.65 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  36.08 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  34.3 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  36.28 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  34.33 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  33.48 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  34.78 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  34.78 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  34.78 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  34.78 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  34.78 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  34.98 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  34.75 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  35.06 
 
 		 485 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  31.87 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  33.11 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  33.26 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  32.95 
 
 		 458 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  33.1 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  32.89 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  32.89 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  32.89 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  33.33 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  32.89 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  33.73 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  32.89 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.22 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  32.71 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  30.47 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  33.11 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  33.11 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  33.11 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  33.11 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  29.65 
 
 		 452 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  29.65 
 
 		 452 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  32.87 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  31.52 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  33.33 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  32.67 
 
 		 447 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  32.59 
 
 		 456 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  33.87 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  31.44 
 
 		 453 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  32.1 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  30.72 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  30.09 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  32.27 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  34.04 
 
 		 490 aa  181  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  30.72 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  30.72 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  32.03 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  32.82 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  33.11 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  32.03 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  33.19 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  30.9 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  31.24 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  31.24 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  33.19 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  33.19 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  31.42 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  31.24 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  31.24 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  31.24 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  31.24 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>