299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0207 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  100 
 
 		 451 aa  865    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  69.58 
 
 		 455 aa  593  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  59.65 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  46.38 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  46.73 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  46.1 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  45.92 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  45.8 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  46.38 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  44.89 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  45.33 
 
 		 452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  45.56 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  44.67 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  44.67 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  44.67 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  44.95 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  46.55 
 
 		 450 aa  354  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  45.23 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  45.11 
 
 		 452 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  45.11 
 
 		 452 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  44.34 
 
 		 455 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  45.33 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  47.14 
 
 		 450 aa  338  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  43.5 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  47.91 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  42.89 
 
 		 455 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  41.43 
 
 		 452 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  42.09 
 
 		 452 aa  318  9e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  42.14 
 
 		 447 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  43.67 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  42.26 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  40.44 
 
 		 447 aa  295  8e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  43.39 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  37.56 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  37.44 
 
 		 460 aa  262  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  33.72 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  32.61 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  34.58 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  35.68 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  33.72 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  32.04 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  33.7 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  32.68 
 
 		 474 aa  193  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  32.24 
 
 		 477 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  32.24 
 
 		 477 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  32.55 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  32.55 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  32.55 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  32.55 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  31.7 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  32.55 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  32.03 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  32.68 
 
 		 474 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  32.46 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  33.88 
 
 		 490 aa  183  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  31.21 
 
 		 447 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  31.07 
 
 		 453 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  30.99 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  30.99 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  31.22 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  29.93 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  31.76 
 
 		 449 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  29.57 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  31 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  30.45 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  31.13 
 
 		 446 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  29.29 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  34.76 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  33.8 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  33.49 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  30.21 
 
 		 485 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  30 
 
 		 485 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  30.23 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  28.57 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  28.57 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  30.22 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  29.12 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  28.29 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  29.77 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  28.38 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  28.99 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  29.27 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  30 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  28.16 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  28.82 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  28.6 
 
 		 441 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  28.6 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  28.6 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  28.38 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  28.86 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  30.91 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  30.9 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  30.47 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  32.45 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  29.68 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  28.7 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  30.36 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  31.08 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  30.36 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  30.36 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>