299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2739 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  100 
 
 		 444 aa  871    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  44.14 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  40.14 
 
 		 446 aa  322  6e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  41.12 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  40.48 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  43.08 
 
 		 452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  40.8 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  44.42 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  41.32 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  41.5 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  40.79 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  41.29 
 
 		 452 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  40.99 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  38.9 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  37.94 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  43.64 
 
 		 447 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  40.58 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  40.58 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  40.58 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  40.35 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  42.86 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  39.22 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  41.02 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  41.02 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  38.84 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  41.02 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  39.64 
 
 		 455 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  40.52 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  39.78 
 
 		 447 aa  282  9e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  37.94 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  35.4 
 
 		 462 aa  279  6e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  37.53 
 
 		 460 aa  275  9e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  37.69 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  40.43 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  35.63 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  37.19 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  30.84 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  33.33 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  33.57 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  35.82 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  34.86 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  33.99 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  32.57 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  32.52 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  32.52 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  32.52 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  32.52 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  32.52 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  32.36 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  31.84 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  30.99 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  31.95 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  30.39 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  29.66 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  31.15 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  30.63 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  29.44 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  29.66 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  29.44 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  31.12 
 
 		 449 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  29.44 
 
 		 441 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  29.21 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  32.31 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  31.38 
 
 		 449 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  30.5 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  32.09 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  31.07 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  30.65 
 
 		 449 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  29.21 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  29.21 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  31.21 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  31.28 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  31.28 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  29.44 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  30.84 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  29.44 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  29.44 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  32.5 
 
 		 446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  29.44 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  29.21 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  31.05 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  32.25 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  31.88 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  29.21 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  31.43 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  31.43 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  31.43 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  32.15 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  28.99 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  31.81 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  33.04 
 
 		 482 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  28.95 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  31.36 
 
 		 450 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  31 
 
 		 450 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  28.54 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  30.99 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  31.59 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  31.59 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  31.59 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  31.59 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>