294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1371 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  100 
 
 		 452 aa  885    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  85.4 
 
 		 452 aa  746    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  69.77 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  68.67 
 
 		 452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  68.46 
 
 		 452 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  67.63 
 
 		 452 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  67.85 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  68.07 
 
 		 452 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  67.85 
 
 		 452 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  67.85 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  67.85 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  68.48 
 
 		 452 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  68.74 
 
 		 450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  65.69 
 
 		 452 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  67.63 
 
 		 452 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  68.07 
 
 		 452 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  68.07 
 
 		 452 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  65.24 
 
 		 452 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  67.85 
 
 		 452 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  67.73 
 
 		 450 aa  551  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  64.49 
 
 		 455 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  54.97 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  53.62 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  53.15 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  49.34 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  49.01 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  51.44 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  47.17 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  45.77 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  42.49 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  41.27 
 
 		 462 aa  331  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  42.96 
 
 		 460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  40.18 
 
 		 455 aa  325  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  39.22 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  38.77 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  37.91 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  37.92 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  34.73 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  34.07 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  34.36 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  32.89 
 
 		 482 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  34.39 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  34.39 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  34.39 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  34.39 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  34.39 
 
 		 498 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  32.5 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  34.89 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  32.49 
 
 		 477 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  32.68 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  32.68 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  32.68 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  32.68 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  32.68 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  32.68 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  31.97 
 
 		 487 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  33.48 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  32.91 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  32.97 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  31.26 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  32.75 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.31 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  32.75 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  32.75 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  32.75 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  32.13 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  31.03 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  30.8 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  30.8 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  30.8 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  30.8 
 
 		 441 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  31.45 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  31.18 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  33.48 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  30.77 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  33.48 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  33.96 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  33.18 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  30.57 
 
 		 441 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  30.57 
 
 		 441 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  33.26 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  30.07 
 
 		 452 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  32.82 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  32.65 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  31.26 
 
 		 494 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  30.44 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  30.44 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  30.44 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  30.44 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  30.44 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  30.44 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  31.43 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  28.99 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  32.19 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  32.29 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  31.98 
 
 		 467 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  29.12 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  32.37 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  32.24 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  30.3 
 
 		 461 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>