298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  100 
 
 		 455 aa  870    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  59.59 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  57.56 
 
 		 452 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  56.36 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  59.82 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  57.37 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  56.14 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  56.07 
 
 		 452 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  60.36 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  59.69 
 
 		 455 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  55.41 
 
 		 452 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  57.4 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  57.4 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  57.4 
 
 		 452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  56.51 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  57.4 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  57.71 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  56.51 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  56.51 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  56.29 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  52.42 
 
 		 452 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  51.13 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  50.8 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  53.1 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  47.68 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  45.93 
 
 		 447 aa  360  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  50.88 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  47.43 
 
 		 461 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  42.38 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  42.08 
 
 		 455 aa  335  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  44.72 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  39.66 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  38.21 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  41.24 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  40 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  38.06 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  37.14 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  35.75 
 
 		 462 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  37.37 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  35.03 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  35.07 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  35.79 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  36.3 
 
 		 477 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  36.3 
 
 		 477 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  36.09 
 
 		 477 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  32.74 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  32.74 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  32.74 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  32.74 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  32.74 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  35.41 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  36.91 
 
 		 485 aa  183  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  34.14 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  35.58 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  34.57 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  33.1 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  32.88 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  33.41 
 
 		 494 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  31.71 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  30.61 
 
 		 453 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  33.64 
 
 		 460 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  32.13 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  32.81 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  31.21 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  34.72 
 
 		 490 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  33.77 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  31.81 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  34.39 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  30.79 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  32.52 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  32.52 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  31.26 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  30.79 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  30.79 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  32.3 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  30.79 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  32.3 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  32.3 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  32.3 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  32.3 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  32.3 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  32.3 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  32.3 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  32.3 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  30.16 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  31.82 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  30.85 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  31.42 
 
 		 477 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  30.24 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  34.77 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  31.67 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  32.43 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  31.51 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  30.09 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  31.34 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  30.43 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  32.13 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  32.06 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  30.52 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  31.61 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>