More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  97.79 
 
 		 452 aa  831    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  81.26 
 
 		 455 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  100 
 
 		 452 aa  882    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  71.02 
 
 		 452 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  70.52 
 
 		 452 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  70.86 
 
 		 452 aa  621  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  70.81 
 
 		 452 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  69.76 
 
 		 452 aa  614  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  70.8 
 
 		 452 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  73.01 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  70.86 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  68.87 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  74.37 
 
 		 450 aa  611  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  70.86 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  70.86 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  70.86 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  71.08 
 
 		 452 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  71.08 
 
 		 452 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  70.86 
 
 		 452 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  64.68 
 
 		 452 aa  561  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  61.64 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  59.78 
 
 		 455 aa  484  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  58.31 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  57.52 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  54.52 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  50.11 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  53.78 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  49.77 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  50.12 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  45.35 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  44.93 
 
 		 451 aa  362  8e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  43.49 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  46.42 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  43.39 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  42.51 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  40.04 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  41.03 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  39.42 
 
 		 461 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  36.79 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  37.97 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  36.06 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  37.65 
 
 		 498 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  37.65 
 
 		 498 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  37.65 
 
 		 498 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  37.65 
 
 		 498 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  37.41 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  35.38 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  35.26 
 
 		 487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  36.34 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  33.61 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  34.25 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  35.37 
 
 		 448 aa  192  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  32.17 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  32.89 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  32.96 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  32.66 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  32.82 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  33.1 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  32.37 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  32.67 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  32.67 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  32.67 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  35.14 
 
 		 490 aa  189  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  32.59 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  34.75 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  32.59 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  32.59 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  32.59 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  32.67 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  31.47 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  32.59 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  34.44 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  33.33 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  32.71 
 
 		 485 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  34.07 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  34.07 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  34.07 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  34.16 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  34.74 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  30.68 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  33.04 
 
 		 452 aa  183  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  31.43 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  33.48 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  34.62 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  32.44 
 
 		 460 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  29.78 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  33.85 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2450  permease DsdX  32.88 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  30.7 
 
 		 454 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  30.7 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  34.14 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  30.48 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  30.48 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  33.33 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  30.48 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  30.48 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  30.98 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  33.1 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  30.26 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  32.65 
 
 		 458 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>