More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3044 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  100 
 
 
444 aa  871    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  39.26 
 
 
446 aa  323  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  40.36 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  40.24 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  39.91 
 
 
461 aa  305  8.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  40.68 
 
 
452 aa  302  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  40.92 
 
 
452 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  41.22 
 
 
447 aa  299  7e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  39.55 
 
 
452 aa  299  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  40 
 
 
452 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  41.38 
 
 
452 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  40.09 
 
 
452 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  40.81 
 
 
452 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  41.44 
 
 
450 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  38.41 
 
 
452 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  40.62 
 
 
446 aa  289  6e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  39.04 
 
 
452 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  39.46 
 
 
452 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  42.01 
 
 
450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  38.79 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  38.95 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  40.31 
 
 
453 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  38.57 
 
 
452 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  38.57 
 
 
452 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  38.57 
 
 
452 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  39.46 
 
 
452 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  39.46 
 
 
452 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  40.72 
 
 
447 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  38.26 
 
 
452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  39.69 
 
 
452 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  36.1 
 
 
460 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  37.56 
 
 
455 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  37.19 
 
 
444 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  35.15 
 
 
455 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  34.93 
 
 
462 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  35.62 
 
 
462 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  35.36 
 
 
452 aa  240  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  34.7 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  32.2 
 
 
482 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  34.22 
 
 
461 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.84 
 
 
464 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  33.75 
 
 
464 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  34.13 
 
 
498 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  34.13 
 
 
498 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  34.13 
 
 
498 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  34.13 
 
 
498 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  34.13 
 
 
498 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  32.12 
 
 
446 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  31.76 
 
 
467 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  31.39 
 
 
488 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  32.09 
 
 
449 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  31.99 
 
 
447 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  30.33 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  29.67 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  32.1 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  32.71 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  31.93 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  31.85 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  31.85 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  31.6 
 
 
449 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  31.88 
 
 
450 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  32.13 
 
 
450 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  31.11 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  32.6 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  32.07 
 
 
450 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  31.14 
 
 
450 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  30.18 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  31.47 
 
 
450 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  33.04 
 
 
441 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  32.25 
 
 
460 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  32.22 
 
 
450 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  33.04 
 
 
441 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  33.04 
 
 
441 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  32.82 
 
 
441 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  30.38 
 
 
465 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  33.48 
 
 
441 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  32.33 
 
 
485 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  33.04 
 
 
441 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  32.82 
 
 
441 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  30.91 
 
 
441 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  31.94 
 
 
487 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  30.67 
 
 
441 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  30.91 
 
 
441 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  32.82 
 
 
441 aa  193  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  30.91 
 
 
441 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  32.82 
 
 
441 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  31.78 
 
 
454 aa  192  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  31.78 
 
 
454 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  30.68 
 
 
441 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  30.62 
 
 
441 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  32.58 
 
 
452 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  31.56 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  31.56 
 
 
454 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  31.56 
 
 
454 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  31.56 
 
 
454 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  31.12 
 
 
458 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  30.68 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  30.68 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  28.67 
 
 
447 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  30.27 
 
 
450 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>