298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1717 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  72.58 
 
 		 445 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  72.58 
 
 		 445 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  72.58 
 
 		 445 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  73.26 
 
 		 445 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  73.26 
 
 		 445 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2450  permease DsdX  71.46 
 
 		 445 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  73.26 
 
 		 445 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  72.58 
 
 		 445 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  100 
 
 		 445 aa  872    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  72.58 
 
 		 445 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  73.03 
 
 		 445 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  73.48 
 
 		 445 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  73.26 
 
 		 445 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  71.46 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  46.78 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  47.61 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  41.97 
 
 		 450 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  41.61 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  41.28 
 
 		 453 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  40.56 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  42.17 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  41.34 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  41.8 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  40.14 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  41.11 
 
 		 449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  41.5 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  41.5 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  41.5 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  39.6 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  41.3 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  41.28 
 
 		 453 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  40.58 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  40.95 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  40.71 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  38.84 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  37.44 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  41.18 
 
 		 453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.18 
 
 		 453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  40.48 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  38.86 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  40.48 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  37.21 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  40.89 
 
 		 453 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  40.95 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  40.84 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  40.84 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.95 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.95 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.95 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.95 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  38.65 
 
 		 465 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  39.68 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  38.39 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  38.85 
 
 		 450 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  39.77 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  39.5 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  38.85 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  37.44 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  37.44 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  37.44 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  38.53 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  37.21 
 
 		 438 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  38.53 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  38.53 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  38.53 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  36.22 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  38.3 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  38.3 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  36.22 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  37.67 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  36.67 
 
 		 449 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  37.22 
 
 		 449 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  36.94 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  37.24 
 
 		 450 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  37.24 
 
 		 450 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  36.07 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  36.07 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  36.07 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  37.24 
 
 		 450 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  36.07 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  40.65 
 
 		 450 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  35.84 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  34.22 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  34.47 
 
 		 439 aa  259  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2768  gluconate transporter  36.71 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  38.38 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  34.38 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  34.38 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  34.38 
 
 		 441 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  37.22 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  34.38 
 
 		 441 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>