More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0017 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  72.54 
 
 		 498 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  72.54 
 
 		 498 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  72.54 
 
 		 498 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  72.54 
 
 		 498 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  100 
 
 		 490 aa  963    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  72.54 
 
 		 498 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  63.86 
 
 		 494 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  56.07 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  52.78 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  39.53 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  39.44 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  38.68 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  40.13 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  39.49 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  36.36 
 
 		 448 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  39.34 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  38.76 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  33.26 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  33.26 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  35.73 
 
 		 461 aa  235  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  33.26 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  33.26 
 
 		 447 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  34.38 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  33.41 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.16 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  36.47 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  33.26 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  35.12 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  34.42 
 
 		 449 aa  224  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  34.65 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  33.33 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  33.33 
 
 		 438 aa  223  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  32.68 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  35.82 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  33.81 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  39.25 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  34.19 
 
 		 449 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  35.83 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  33.63 
 
 		 438 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  31.37 
 
 		 439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  37.56 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  33.72 
 
 		 449 aa  216  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  33.88 
 
 		 451 aa  216  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  33.49 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  32.67 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  35.7 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  35.15 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  32.89 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  32.89 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  32.89 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  34.92 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  34.05 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  33.18 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  33.97 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  36.53 
 
 		 453 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  35.19 
 
 		 452 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  36.08 
 
 		 455 aa  209  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  33.18 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  33.18 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  34.81 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  33.87 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  33.18 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  33.87 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  33.18 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  33.87 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  33.19 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  33.18 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  34.34 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  34.69 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  33.64 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  36.49 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  31.17 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  32.22 
 
 		 450 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  33.41 
 
 		 450 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  32.9 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  33.64 
 
 		 445 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  32.9 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  32.9 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  32.9 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  34.4 
 
 		 453 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  36.26 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  34.4 
 
 		 453 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  34.73 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  34.4 
 
 		 453 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  36.26 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  36.26 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  34.4 
 
 		 453 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  32.74 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  33.56 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>