293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2333 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  100 
 
 		 468 aa  899    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  33.12 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  34 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  30.13 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  30.95 
 
 		 498 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  30.95 
 
 		 498 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  30.95 
 
 		 498 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  30.95 
 
 		 498 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  30.95 
 
 		 498 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  29.21 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  31.15 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  30.42 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  29.76 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  31.04 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  29.41 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  29.69 
 
 		 438 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  29.69 
 
 		 438 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  29.69 
 
 		 438 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  29.69 
 
 		 438 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  29.76 
 
 		 438 aa  183  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  33.56 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  29.02 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  30 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  31.91 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  29.46 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  30.99 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  30.45 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  28.44 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  29.66 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  30.24 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  30.24 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  28.22 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  30.49 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  30.16 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  30.16 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  29.72 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  29.72 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  29.72 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  30.16 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  30.16 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  30.16 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  30.16 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  30.16 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  31.51 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  31.32 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  29.02 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  30.45 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  29.69 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  30.6 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  30.53 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  31.32 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  28.17 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  28.88 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  28.82 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  28.21 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  29.81 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  28.17 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  28.17 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  29.61 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  29.5 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  29.05 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  28.41 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  30.17 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  28.6 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3386  gluconate transporter  26.95 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  29 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2768  gluconate transporter  28.94 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  28.6 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  28.32 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  29.82 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  28.95 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  27.99 
 
 		 460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  30.92 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  28.38 
 
 		 449 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  28.82 
 
 		 452 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  28.82 
 
 		 452 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  28.82 
 
 		 452 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  29.22 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  29.31 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  28.16 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  29.22 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  30.83 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  32.14 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  27.21 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  27.54 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  29.61 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  31.32 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  31.4 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  27.73 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  27.23 
 
 		 439 aa  163  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  27.53 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>