179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1479 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  100 
 
 
433 aa  838    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  65.03 
 
 
431 aa  533  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  65.49 
 
 
434 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  44.8 
 
 
419 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  44.57 
 
 
419 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  46.88 
 
 
424 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  45.48 
 
 
422 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  45.24 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  45.24 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  45.71 
 
 
421 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  45.24 
 
 
422 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  45.24 
 
 
422 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  45.24 
 
 
422 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  45.24 
 
 
422 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  40.24 
 
 
418 aa  296  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  44.08 
 
 
421 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  22.6 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  22.55 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  25 
 
 
452 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  24.57 
 
 
462 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  21.88 
 
 
453 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  25.85 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  27.61 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  25.87 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  27.59 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  21.95 
 
 
449 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  25.87 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  25.87 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  25.87 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  25.87 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  28.63 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  27.16 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  27.16 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  27.16 
 
 
441 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  27.16 
 
 
441 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  27.16 
 
 
441 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  23.26 
 
 
449 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  22.95 
 
 
450 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  22.22 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  27.27 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  28.21 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  23.06 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  23.06 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  23.06 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  23.06 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  23.53 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  23.53 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  23.06 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  23.06 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  27.73 
 
 
452 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  23.06 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  26.72 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  26.72 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  28.1 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  28.1 
 
 
441 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  24.94 
 
 
464 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  28.1 
 
 
441 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  28.1 
 
 
441 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  27.85 
 
 
452 aa  56.6  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  23.38 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  28.1 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  27.35 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  26.67 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  30.05 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  26.41 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  25 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  24.4 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  28.1 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  31.54 
 
 
452 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  26.99 
 
 
460 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  21.28 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  21.28 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  23.91 
 
 
449 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  24.29 
 
 
449 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1403  high-affinity gluconate transporter  28.95 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.633115  normal  0.430036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  31.01 
 
 
455 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  24.09 
 
 
449 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  25.75 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  25.75 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  25.75 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  21.04 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  24.4 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  27.1 
 
 
453 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  22.97 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  24.38 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  24.38 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  27.1 
 
 
453 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  24.76 
 
 
477 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  22.37 
 
 
445 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  21.31 
 
 
438 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  24.9 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  24.54 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  23.91 
 
 
449 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  23.77 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  23.77 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  23.77 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  23.77 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  23.77 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  23.65 
 
 
449 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  23.77 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>