More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04190 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  100 
 
 
447 aa  871    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  100 
 
 
447 aa  871    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0693  fructuronate transporter  82.92 
 
 
447 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  82.92 
 
 
493 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  871    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  100 
 
 
447 aa  871    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  100 
 
 
447 aa  871    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  100 
 
 
447 aa  871    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  100 
 
 
447 aa  871    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  40.87 
 
 
438 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  40.18 
 
 
438 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  40.18 
 
 
438 aa  345  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  39.95 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  39.73 
 
 
438 aa  342  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  40.87 
 
 
438 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  40.14 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  40.46 
 
 
439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  40.46 
 
 
439 aa  336  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  40.46 
 
 
439 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  40.46 
 
 
439 aa  335  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  40.46 
 
 
439 aa  335  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  40.41 
 
 
438 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  40.64 
 
 
438 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  40.37 
 
 
439 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  40.41 
 
 
438 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  40.41 
 
 
438 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2768  gluconate transporter  39.41 
 
 
444 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  40.46 
 
 
439 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  40.46 
 
 
439 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  40.46 
 
 
463 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  40.46 
 
 
463 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  40.46 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  36.7 
 
 
452 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  36.7 
 
 
452 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  37.88 
 
 
450 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  36.26 
 
 
449 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7002  gluconate transporter  36.57 
 
 
445 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  36.66 
 
 
452 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  37.12 
 
 
499 aa  294  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  37.07 
 
 
450 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  37.07 
 
 
450 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  37.07 
 
 
450 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  36.78 
 
 
448 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  36.78 
 
 
448 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  36.78 
 
 
448 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  36.78 
 
 
448 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  36.78 
 
 
448 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  36.78 
 
 
448 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  38.07 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0923  H+/gluconate symporter related permease  37.28 
 
 
444 aa  286  8e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  35.85 
 
 
439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  37.84 
 
 
450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  37.47 
 
 
449 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3386  gluconate transporter  35.36 
 
 
438 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  37.65 
 
 
449 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  35.57 
 
 
449 aa  279  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  36.55 
 
 
449 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  37.33 
 
 
450 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  37.76 
 
 
450 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  36.3 
 
 
450 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  37.33 
 
 
450 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  36.64 
 
 
450 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  36.95 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  33.85 
 
 
448 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  34.7 
 
 
450 aa  266  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  34.82 
 
 
453 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.44 
 
 
453 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  37.33 
 
 
465 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  34.68 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  34.98 
 
 
457 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  33.93 
 
 
453 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3704  gluconate transporter  36.95 
 
 
449 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  35.02 
 
 
450 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  35.71 
 
 
465 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2470  gluconate transporter  33.26 
 
 
438 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  33.73 
 
 
450 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1028  gluconate transporter  32.28 
 
 
434 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238544  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  33.71 
 
 
453 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  33.93 
 
 
453 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  34.19 
 
 
448 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  33.93 
 
 
453 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  34.53 
 
 
450 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  34.53 
 
 
450 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  33.93 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  37.41 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  32.81 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  33.93 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  33.93 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  33.93 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  33.93 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>