281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4051 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  99.29 
 
 
422 aa  802    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  100 
 
 
422 aa  808    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  100 
 
 
422 aa  808    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  76.54 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  76.54 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  76.54 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  76.54 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  78.67 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  75.48 
 
 
421 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  65.87 
 
 
419 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  65.62 
 
 
419 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  67.79 
 
 
424 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  53.38 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  45.12 
 
 
433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  47.03 
 
 
434 aa  348  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  42.66 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  27.59 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  25.45 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  24.21 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  27.15 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  27.15 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  24.93 
 
 
494 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  27.15 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  27.15 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  23.32 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  26.28 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  27.15 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  26.6 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  23.36 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  26.2 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  22.84 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  22.84 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  22.84 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  22.84 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  22.84 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  24.6 
 
 
450 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  22.84 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  22.84 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  22.51 
 
 
449 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  22.51 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  24.19 
 
 
449 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  23.17 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0693  fructuronate transporter  23.17 
 
 
447 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  25 
 
 
474 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  24.94 
 
 
464 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  25.39 
 
 
464 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  33.99 
 
 
454 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  33.99 
 
 
454 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  33.99 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  23.08 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  25.57 
 
 
468 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  33.99 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  33.99 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  25.9 
 
 
450 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  25.9 
 
 
450 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  35.33 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  23.04 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  27.3 
 
 
477 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  23.83 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  23.83 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  23.83 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  34.39 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  27.51 
 
 
458 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  22.86 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  25.4 
 
 
445 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  25.13 
 
 
455 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  23.59 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  25.79 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  23.55 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  22.86 
 
 
438 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  24.23 
 
 
449 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  24.82 
 
 
450 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  22.86 
 
 
438 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1070  Gluconate transporter  29.13 
 
 
481 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  23.28 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1158  gluconate transporter  27.78 
 
 
456 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.956779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  23.28 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  23.28 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  26.97 
 
 
458 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  21.22 
 
 
452 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  21.22 
 
 
452 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  24.26 
 
 
450 aa  59.7  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  22.6 
 
 
438 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  24.14 
 
 
459 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  25.96 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  22.6 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  23.43 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  22.69 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  25.12 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  23.12 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  22.1 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  23.12 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  23.23 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  23.12 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  22.1 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  26.78 
 
 
452 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  23.29 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  23.12 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7014  gluconate transporter  25.75 
 
 
458 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  hitchhiker  0.00603949 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  22.58 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>