180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0794 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  100 
 
 
418 aa  807    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  58.45 
 
 
419 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  58.45 
 
 
419 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  54.07 
 
 
424 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  55.26 
 
 
422 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  55.26 
 
 
422 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  55.26 
 
 
422 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  52.87 
 
 
422 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  55.26 
 
 
422 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  52.87 
 
 
422 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  53.62 
 
 
421 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  52.87 
 
 
422 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  54.7 
 
 
421 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  44.13 
 
 
431 aa  342  5e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  44.31 
 
 
434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  40.24 
 
 
433 aa  312  9e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  26.99 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  27.52 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  26.87 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  26.87 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  26.87 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  26.87 
 
 
498 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  26.87 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  24.16 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  25.71 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  26.12 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  26.12 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  28.5 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  26.12 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  28.83 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  28.85 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  28.99 
 
 
452 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  27.91 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  23.62 
 
 
469 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  30.92 
 
 
454 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  30.92 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  30.92 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  30.92 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  30.92 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  29.12 
 
 
456 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  27.46 
 
 
461 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  30.43 
 
 
454 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  29.95 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  23.38 
 
 
490 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  27.56 
 
 
458 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  20.96 
 
 
449 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  26.72 
 
 
458 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  25.42 
 
 
445 aa  60.1  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  23.45 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  25.32 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  27.23 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  25.48 
 
 
438 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  25.48 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  22.41 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  24.42 
 
 
452 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  24.42 
 
 
452 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  25.48 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  23.64 
 
 
449 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  25.59 
 
 
485 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  25.83 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  26.01 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  26.01 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  21.89 
 
 
487 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  26.01 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  25.45 
 
 
485 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  27 
 
 
458 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  27.85 
 
 
458 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  25.89 
 
 
452 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  25.66 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  26.01 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  26.01 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  22.88 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  27.19 
 
 
455 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  23.44 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  23.08 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  24.79 
 
 
445 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  23.08 
 
 
449 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  23.44 
 
 
449 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  21.32 
 
 
450 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  25.56 
 
 
445 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  24.2 
 
 
458 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  25.11 
 
 
453 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  25.57 
 
 
457 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  26.47 
 
 
459 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  23.18 
 
 
438 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.590418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  24 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  23.6 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  24 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1028  gluconate transporter  22.31 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238544  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  28.08 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  26.67 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  23.6 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>