235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0853 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  100 
 
 		 419 aa  794    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  99.76 
 
 		 419 aa  791    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  66.43 
 
 		 424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  65.87 
 
 		 422 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  65.87 
 
 		 422 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  65.87 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  65.87 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  65.87 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  65.87 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  65.87 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  65.87 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  63.86 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  58.67 
 
 		 418 aa  428  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  46.26 
 
 		 431 aa  362  7.0000000000000005e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  47.88 
 
 		 434 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  45.12 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  28.03 
 
 		 447 aa  86.7  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  24.88 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  27.91 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  23.83 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  27.59 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  24.15 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  24.58 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  26.02 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  27.19 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  25.98 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  23.34 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  26.42 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  23.9 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  25.4 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  23.28 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  23.29 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  25.9 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  26.51 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  25.2 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  25.2 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  25.2 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  25.6 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  24.5 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  25.2 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  24.38 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  25.2 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  23.7 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  23.7 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  24.28 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  24.23 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2847  Gluconate transporter  31.25 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  24.72 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  24.28 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  22.37 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  22.37 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  21.36 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  23.78 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  23.38 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  22.47 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  25.74 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  20.82 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  23.17 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  23.17 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  23.17 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  23.17 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  23.17 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  23.17 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  23.17 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  22.88 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  25.32 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.88 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  23.2 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  24.08 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  24.21 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  23.84 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  22.07 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  23.27 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  22.53 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  23.5 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  24.5 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  24.7 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  24.94 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.53 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.53 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.53 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.53 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0693  fructuronate transporter  24.93 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  23.86 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  25.88 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  22.07 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  22.43 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  24.93 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  22.43 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  24.94 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  22.07 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  22.07 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  23.86 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  25.61 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  27.98 
 
 		 453 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  22.07 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  22.07 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  21.36 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  24.75 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  24 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>