More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7014 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7014  gluconate transporter  100 
 
 		 458 aa  875    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  hitchhiker  0.00603949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3032  gluconate transporter  97.16 
 
 		 458 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0909062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1158  gluconate transporter  74.72 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.956779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1347  gluconate transporter family protein  74.21 
 
 		 448 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  48 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  49.42 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  48.2 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  44.84 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  44.39 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  43.57 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  43.57 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  43.34 
 
 		 450 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  43.21 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  41.27 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  41.35 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  41.51 
 
 		 449 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  41.32 
 
 		 465 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  41.51 
 
 		 449 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  42.53 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  39.95 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  42.21 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  40.89 
 
 		 449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  40.89 
 
 		 449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  41.86 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  41.05 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  42.53 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  40.09 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  41.98 
 
 		 449 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  41.75 
 
 		 449 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  42.57 
 
 		 450 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  41.57 
 
 		 453 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  41.35 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  43.78 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  41.87 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  41.35 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  41.35 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  42.09 
 
 		 449 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  39.72 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  40.9 
 
 		 450 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  41.57 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  41.65 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.65 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  38.8 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  43.57 
 
 		 450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.43 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.43 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.43 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  41.8 
 
 		 446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.8 
 
 		 446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  41.8 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  41.8 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  41.35 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  41.35 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0652  gluconate transporter  39.56 
 
 		 461 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0685  gluconate transporter  39.12 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0925038  normal  0.0301059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3107  gluconate transporter  41.78 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  39.32 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  39.32 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3131  gluconate transporter  40.62 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  40.85 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  41.04 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  39.81 
 
 		 438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2796  gluconate transporter  39.86 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  38.5 
 
 		 448 aa  299  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  36.82 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  38.44 
 
 		 452 aa  296  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  36.36 
 
 		 441 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  36.59 
 
 		 441 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  39.72 
 
 		 438 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1028  gluconate transporter  40.05 
 
 		 434 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238544  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7002  gluconate transporter  42.39 
 
 		 445 aa  295  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  36.36 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  36.36 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  36.36 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  39.72 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0696  gluconate transporter  39.76 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  38.66 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  39.49 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  36.14 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  36.14 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  36.77 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  39.12 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  39.12 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  37.21 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  39.12 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  37.73 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  37.73 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  38.89 
 
 		 438 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  38.89 
 
 		 438 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  38.88 
 
 		 448 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  38.88 
 
 		 448 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  37.5 
 
 		 441 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  38.88 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  38.88 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  38.88 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  38.88 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  37.73 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  37.5 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  39.67 
 
 		 438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  37.27 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>