292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3131 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0696  gluconate transporter  79.64 
 
 		 461 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0652  gluconate transporter  79.39 
 
 		 461 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2796  gluconate transporter  77.78 
 
 		 461 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3131  gluconate transporter  100 
 
 		 462 aa  896    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0685  gluconate transporter  79.39 
 
 		 461 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0925038  normal  0.0301059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  40.32 
 
 		 450 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  39.36 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  40.68 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  40.09 
 
 		 449 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  40.09 
 
 		 449 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  40.87 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  39.41 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  42.42 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  38.33 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  38.33 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  38.11 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  39.91 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  38.46 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  39.47 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  38.24 
 
 		 450 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  38.67 
 
 		 450 aa  312  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  37.53 
 
 		 449 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  37.33 
 
 		 453 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  37.33 
 
 		 453 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  37.33 
 
 		 453 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  39.78 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  37.33 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  38.05 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  38.29 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.29 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.29 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.29 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.29 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  38.67 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.67 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  41.8 
 
 		 457 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  41.48 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  36.76 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  36.85 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3032  gluconate transporter  40.44 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0909062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  37.85 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  36.91 
 
 		 449 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  37.72 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  37.56 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  36.47 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7014  gluconate transporter  40.62 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  hitchhiker  0.00603949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  37.75 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  37.72 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  37.56 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  37.94 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  37.33 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  37.61 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  37.61 
 
 		 438 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  38.37 
 
 		 465 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  37.39 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  37.36 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  37.53 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  37.53 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  38 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  37.83 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  38.27 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  38.6 
 
 		 448 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  38.6 
 
 		 448 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  38.6 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  38.6 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  38.6 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  38.6 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  37.03 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  37.03 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  37.03 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  37.39 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  37.39 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  37.39 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  37.39 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  37.39 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  36.05 
 
 		 453 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  37.91 
 
 		 438 aa  289  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1158  gluconate transporter  40.58 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.956779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1347  gluconate transporter family protein  40.35 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  36.47 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  35.68 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  35.9 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  35.68 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  35.46 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  35.53 
 
 		 463 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  35.53 
 
 		 463 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  35.46 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  35.24 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  36.2 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  36.2 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  35.24 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>