206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1278 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  33.05 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  38.32 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  25.32 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  27.43 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  26.15 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  25.59 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  23.19 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  30.84 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  30.25 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  29.84 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  29.55 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  30 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  32.43 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  24.31 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  23.14 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  25.12 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  27.12 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  30.84 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  24.32 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  32.71 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  29.81 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.52 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  28.24 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  23.71 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  31.48 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  25.58 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  29.1 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  30.84 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  22.86 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  33.33 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  23.5 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  31.78 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  29.27 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  29.27 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  29.27 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  30.84 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  23.45 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  30.7 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  25.29 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.09 
 
 		 747 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  24.89 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  21.63 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  27.45 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  23.45 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  27.73 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  23.55 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  31.78 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  25.75 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  31.78 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  29.91 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  27.93 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  27.93 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.64 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  28.97 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  28 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  29.63 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  27.45 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  23.14 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  29.82 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  23.14 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  23.14 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  23.14 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  23.14 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  23.14 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  28.7 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>