93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1618 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  100 
 
 		 225 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  46.04 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  41.26 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  35.77 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  36.23 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  39.29 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  36.02 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  33.74 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  39.07 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  37.14 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  36.67 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  41.57 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  37.98 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  37.14 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  38.1 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  34.33 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  31.14 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  45.45 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  35.57 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.55 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  34.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  30.7 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  28.17 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  34.64 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  35.62 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  35.07 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 159 aa  52.4  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  31.94 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  35.22 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  29.82 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  35.62 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 338 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  42.42 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  30.56 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  40.48 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  35.64 
 
 		 170 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  39.58 
 
 		 178 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  35.76 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  36.91 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  34.85 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  31.5 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  33.75 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.09 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  33.75 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  38.83 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  27.74 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  34.06 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 137 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  23.87 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 137 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  30.21 
 
 		 137 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  31.31 
 
 		 137 aa  45.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 168 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  43.06 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  38.3 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  42.37 
 
 		 171 aa  45.1  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  32.32 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  34.96 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  31.15 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  34.53 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  36.55 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  32.82 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  24.14 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  35.88 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  34.17 
 
 		 138 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  24.64 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  28.72 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  31.82 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  27.08 
 
 		 153 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  30.82 
 
 		 154 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  31.51 
 
 		 156 aa  42  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  32.23 
 
 		 150 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  32.06 
 
 		 161 aa  42  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1166  regulatory protein RecX  25.66 
 
 		 207 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  37.78 
 
 		 201 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  29.13 
 
 		 162 aa  42  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  29.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  31.78 
 
 		 163 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  34.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>