More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1784 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  100 
 
 
419 aa  862  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.17074e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  74.66 
 
 
440 aa  694  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  90.91 
 
 
439 aa  843  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.32327e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.37786e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  74.27 
 
 
441 aa  689  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.1239e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  72.73 
 
 
438 aa  689  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.48125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  72.33 
 
 
410 aa  639  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.44361e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  77.1 
 
 
440 aa  724  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.02583e-05  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.91864e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  100 
 
 
440 aa  907  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.97391e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  92.05 
 
 
439 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  92.27 
 
 
439 aa  850  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  91.82 
 
 
439 aa  846  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  92.27 
 
 
439 aa  850  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.81632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  92.27 
 
 
439 aa  850  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  72.73 
 
 
438 aa  689  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.92356e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  63.21 
 
 
470 aa  603  1e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  58.49 
 
 
486 aa  576  1e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  2.8881e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  46.37 
 
 
458 aa  333  3e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  38.64 
 
 
446 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  41.11 
 
 
430 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  38.26 
 
 
443 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  40.23 
 
 
439 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  38.06 
 
 
433 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  38.06 
 
 
433 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.35092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  38.06 
 
 
433 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  38.06 
 
 
433 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  8.22209e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  38.14 
 
 
419 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  36.23 
 
 
431 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  2.00771e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  36.23 
 
 
431 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  6.65253e-10 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  35.24 
 
 
431 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  3.8042e-08 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  40.23 
 
 
404 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  37.97 
 
 
431 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  34.66 
 
 
482 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  35.06 
 
 
434 aa  255  1e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  41.54 
 
 
438 aa  254  2e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  37.05 
 
 
418 aa  254  2e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  39.36 
 
 
439 aa  254  2e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  33.94 
 
 
423 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  36.05 
 
 
424 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  38.79 
 
 
550 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  1.7693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  34.05 
 
 
418 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  3.41195e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  33.73 
 
 
428 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.85 
 
 
470 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.41 
 
 
512 aa  223  5e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  34.46 
 
 
462 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.95 
 
 
475 aa  219  9e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  33.17 
 
 
475 aa  217  3e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  1.03245e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.9 
 
 
475 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  31.93 
 
 
429 aa  213  4e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.57 
 
 
472 aa  213  6e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  2.82967e-07  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.09 
 
 
468 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  30.63 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  34.77 
 
 
507 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  30.42 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  30.74 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  34.1 
 
 
475 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  34.87 
 
 
436 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.49 
 
 
491 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  30.2 
 
 
468 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.84 
 
 
474 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.09 
 
 
473 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  4.94323e-08  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  30 
 
 
468 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  32.67 
 
 
472 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  35.04 
 
 
447 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.56584e-05  decreased coverage  1.18926e-09 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  35.73 
 
 
353 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.85495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.33 
 
 
473 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
475 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  30.33 
 
 
466 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.32238e-08  hitchhiker  7.91404e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.01 
 
 
480 aa  206  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  33.62 
 
 
482 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  30.37 
 
 
491 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.101e-05  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  30.33 
 
 
466 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.44164e-07  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  28.77 
 
 
433 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.24474e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  30.09 
 
 
439 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.09 
 
 
503 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.86305e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  31.14 
 
 
470 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.41 
 
 
503 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  31.63 
 
 
441 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  30.33 
 
 
490 aa  184  2e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.24 
 
 
460 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  29.86 
 
 
459 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  30.73 
 
 
435 aa  176  1e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  31.27 
 
 
498 aa  175  1e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  29.95 
 
 
741 aa  175  2e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.24744e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  33.62 
 
 
479 aa  174  3e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4303  peptidase M23B  40.95 
 
 
245 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.616883  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0266  peptidase M23B  40.95 
 
 
245 aa  170  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3418  peptidase M23B  40.95 
 
 
245 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  34.78 
 
 
438 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  32.95 
 
 
471 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  32.67 
 
 
471 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.33 
 
 
517 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  2.97595e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.09 
 
 
477 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  31.47 
 
 
490 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>