More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0251 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  98.6 
 
 		 713 aa  1466    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  79.55 
 
 		 704 aa  1181    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  91.82 
 
 		 633 aa  1019    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  98.6 
 
 		 713 aa  1467    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  91.26 
 
 		 633 aa  1013    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  90.46 
 
 		 702 aa  1314    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  82.19 
 
 		 713 aa  1243    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  89.06 
 
 		 702 aa  1296    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  91.82 
 
 		 633 aa  1017    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  89.2 
 
 		 702 aa  1301    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  91.45 
 
 		 633 aa  1014    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 713 aa  1486    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  43.2 
 
 		 741 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  43.06 
 
 		 741 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  43.62 
 
 		 740 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  43.77 
 
 		 740 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  50.09 
 
 		 732 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  43.63 
 
 		 617 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  44.56 
 
 		 725 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  43.28 
 
 		 617 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  43.63 
 
 		 617 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  43.3 
 
 		 609 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  41.84 
 
 		 619 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  41.67 
 
 		 615 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  43.37 
 
 		 618 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  42.7 
 
 		 616 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  42.98 
 
 		 617 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  37.36 
 
 		 678 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  37.46 
 
 		 678 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  37.88 
 
 		 706 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  44.42 
 
 		 610 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  41.75 
 
 		 656 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  41.4 
 
 		 655 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  36.28 
 
 		 682 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  40.26 
 
 		 706 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  39.73 
 
 		 694 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  36.39 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  39.4 
 
 		 687 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  39.37 
 
 		 723 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  39.4 
 
 		 687 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  40.34 
 
 		 1095 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  39.4 
 
 		 687 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  38.76 
 
 		 722 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  36.28 
 
 		 726 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  36.09 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  36.93 
 
 		 722 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  36.31 
 
 		 725 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  40.2 
 
 		 694 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  36.46 
 
 		 725 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  35.98 
 
 		 1017 aa  412  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  38.23 
 
 		 655 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  37.66 
 
 		 699 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  32.21 
 
 		 907 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  35.07 
 
 		 771 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.18 
 
 		 709 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  31.93 
 
 		 741 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  32.43 
 
 		 741 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  32.41 
 
 		 774 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.15 
 
 		 748 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  33.68 
 
 		 689 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  30.73 
 
 		 730 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  33.28 
 
 		 724 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  32.88 
 
 		 689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  30.41 
 
 		 741 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  34.63 
 
 		 697 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  40.68 
 
 		 1019 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  31.15 
 
 		 788 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.8 
 
 		 692 aa  353  7e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  39.16 
 
 		 1019 aa  353  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  39.16 
 
 		 842 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.04 
 
 		 692 aa  351  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  30.57 
 
 		 731 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  36.13 
 
 		 697 aa  350  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 734 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 734 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 731 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 734 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 734 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 734 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 		 727 aa  345  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.28 
 
 		 712 aa  343  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  36.61 
 
 		 706 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  32.58 
 
 		 754 aa  341  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  31.33 
 
 		 754 aa  341  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  31.64 
 
 		 767 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  31.64 
 
 		 767 aa  340  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  30.82 
 
 		 703 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  30.82 
 
 		 755 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  30.86 
 
 		 785 aa  333  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  32.12 
 
 		 778 aa  333  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  30.24 
 
 		 771 aa  331  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  29.34 
 
 		 771 aa  330  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  30.26 
 
 		 756 aa  330  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  31.52 
 
 		 794 aa  326  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  34.27 
 
 		 680 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.03 
 
 		 683 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.09 
 
 		 643 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.08 
 
 		 683 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 		 680 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>