125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0124 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0124  phosphoprotein phosphatase  100 
 
 
824 aa  1674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  38.57 
 
 
851 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0085  phosphoprotein phosphatase  42.21 
 
 
806 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0093  phosphoprotein phosphatase  34.17 
 
 
824 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2681  serine phosphatase  30.66 
 
 
798 aa  439  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2061  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 
792 aa  422  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0790  phosphoprotein phosphatase  30.7 
 
 
781 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2986  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.33 
 
 
804 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.948588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  30.97 
 
 
823 aa  373  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0060  stage II sporulation protein E  30.62 
 
 
792 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00425059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0061  stage II sporulation protein E  30.49 
 
 
808 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  30.49 
 
 
808 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  30.62 
 
 
792 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0061  stage II sporulation protein E  30.49 
 
 
792 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000183348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0073  stage II sporulation protein E  30.75 
 
 
823 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00108149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0069  stage II sporulation protein E  30.88 
 
 
823 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00552781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5247  stage II sporulation protein E  30.88 
 
 
823 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0104377  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0070  stage II sporulation protein E  30.49 
 
 
823 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0057  sporulation stage II protein E  30.19 
 
 
815 aa  351  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  29.64 
 
 
826 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0059  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  29.45 
 
 
826 aa  322  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.03 
 
 
821 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2475  stage II sprulation protein E, putative  28.38 
 
 
796 aa  300  7e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.461942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2789  stage II sporulation protein E  27.57 
 
 
796 aa  300  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00550  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  25.95 
 
 
790 aa  250  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00773403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0078  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  24.52 
 
 
833 aa  247  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0103  serine phosphatase  30.36 
 
 
680 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0143  protein serine/threonine phosphatase  27.1 
 
 
697 aa  209  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000162772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0138  protein serine/threonine phosphatase  30.31 
 
 
527 aa  204  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0217  protein serine/threonine phosphatase  24.87 
 
 
764 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  25.76 
 
 
535 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3169  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 
238 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00870401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  24.12 
 
 
434 aa  65.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  24.91 
 
 
451 aa  65.1  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.77 
 
 
590 aa  64.3  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02070  Stage II sporulation E family protein  30.06 
 
 
384 aa  60.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  28.43 
 
 
693 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.15 
 
 
516 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  27.18 
 
 
687 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0112  protein serine/threonine phosphatase  22.22 
 
 
251 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193496  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  27.83 
 
 
697 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  22.64 
 
 
235 aa  58.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  22.01 
 
 
612 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01780  Serine/threonine specific protein phosphatase  23.01 
 
 
391 aa  55.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  24.29 
 
 
410 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  26.67 
 
 
570 aa  55.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  24.57 
 
 
705 aa  54.7  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  25.12 
 
 
566 aa  54.3  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  24.31 
 
 
708 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  27.8 
 
 
755 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 
453 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  22.58 
 
 
249 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  22.97 
 
 
262 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  24.65 
 
 
377 aa  53.5  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1584  stage II sporulation E family protein  27.56 
 
 
383 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00248045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  26.29 
 
 
683 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  25.48 
 
 
743 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.94 
 
 
572 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  20.35 
 
 
648 aa  51.6  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  24.49 
 
 
781 aa  51.6  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  27.81 
 
 
642 aa  51.6  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  29.24 
 
 
658 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0656  stage II sporulation E family protein  26.09 
 
 
392 aa  51.2  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.04 
 
 
378 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  24.42 
 
 
570 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1680  sigma factor B regulator protein  23 
 
 
333 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  25.56 
 
 
672 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  25 
 
 
400 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.11 
 
 
421 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  24.89 
 
 
744 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  23.38 
 
 
708 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
371 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  27.11 
 
 
378 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.58 
 
 
644 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  28.06 
 
 
560 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  24.88 
 
 
418 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1701  protein serine/threonine phosphatase  22.12 
 
 
253 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.42 
 
 
616 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  24.41 
 
 
512 aa  48.5  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  26.07 
 
 
456 aa  48.9  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  22.64 
 
 
676 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4047  protein serine/threonine phosphatase  23.89 
 
 
391 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.448973  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  20.89 
 
 
705 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  26.29 
 
 
713 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0803  protein serine/threonine phosphatase  21.78 
 
 
246 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  25.86 
 
 
743 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29 
 
 
389 aa  47.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  28.79 
 
 
393 aa  47.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  21.15 
 
 
706 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.05 
 
 
631 aa  47.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.26 
 
 
728 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.67 
 
 
378 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.37 
 
 
606 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.17 
 
 
566 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.52 
 
 
378 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  23.79 
 
 
671 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4565  stage II sporulation E family protein  22.12 
 
 
252 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.446834  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.59 
 
 
445 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.36 
 
 
750 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.53 
 
 
380 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>