More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2566 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 426 aa  879    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  48.71 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  48.48 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  35.13 
 
 		 459 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  36.24 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 451 aa  229  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1999  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 506 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0779114  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3236  Radical SAM domain protein  31.42 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1024  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 441 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 529 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 518 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.77 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.82 
 
 		 864 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 539 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 		 583 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 576 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 576 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  28.3 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1633  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.48 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 472 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 521 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 524 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 		 573 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  29.61 
 
 		 501 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 572 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 494 aa  99.8  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  23.99 
 
 		 495 aa  99.8  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.69 
 
 		 512 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.56 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 564 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  24.22 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 516 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.02 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 488 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 564 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2166  radical SAM family Fe-S protein  27.05 
 
 		 495 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25 
 
 		 472 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 616 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 484 aa  96.3  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 		 541 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.71 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 450 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 723 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 		 1250 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 533 aa  95.1  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.33 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 490 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 502 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  22.83 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 520 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  23.34 
 
 		 501 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.65 
 
 		 425 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  24.02 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  24.02 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  25.63 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 507 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 490 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  28.74 
 
 		 548 aa  90.1  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  23.1 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  25.57 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.05 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  25.3 
 
 		 613 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 474 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 475 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 531 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  28.16 
 
 		 430 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 497 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  23.86 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.31 
 
 		 612 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>