238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0322 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
401 aa  817    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.55 
 
 
746 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
187 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.56 
 
 
757 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
988 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
4079 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
804 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 
1694 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.64 
 
 
818 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 
784 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.9 
 
 
738 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
934 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  31.01 
 
 
252 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.7 
 
 
884 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
1192 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.5 
 
 
887 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
605 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
207 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
1022 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  36.17 
 
 
733 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
615 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  42.62 
 
 
209 aa  53.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.88 
 
 
839 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.52 
 
 
1056 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  42.62 
 
 
239 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
563 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.83 
 
 
736 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 
594 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32.95 
 
 
1240 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 
3301 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
3172 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 
249 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 
249 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1112 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  37.8 
 
 
837 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43955  TRP-containing protein  46.15 
 
 
453 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0248757  normal  0.0716262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.33 
 
 
883 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
778 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  30.69 
 
 
240 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 
593 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
594 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.07 
 
 
462 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  35.96 
 
 
233 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
886 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.06 
 
 
340 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
621 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  31.17 
 
 
937 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  36.05 
 
 
539 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.94 
 
 
798 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 
237 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  36.56 
 
 
936 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.5 
 
 
1023 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
642 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  35.23 
 
 
1676 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.08 
 
 
725 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
689 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
594 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2035  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
194 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  35.53 
 
 
594 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
522 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
878 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
593 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  32.84 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.06 
 
 
1056 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
886 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
522 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.34 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 
520 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  29.91 
 
 
583 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
196 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.23 
 
 
1737 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1520  Tetratricopeptide repeat protein  31.71 
 
 
230 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.78 
 
 
810 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1744  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
271 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.45 
 
 
706 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.57 
 
 
622 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 
297 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.67 
 
 
1007 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  30.61 
 
 
729 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 
758 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 
297 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
579 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
718 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>