59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1105 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  80.75 
 
 		 240 aa  354  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  83.25 
 
 		 209 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  32.2 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  31.49 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  31.88 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  31.72 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  29.51 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  29.51 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  29.51 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0591449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  29.51 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  29.51 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  29.51 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  37.5 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  28.96 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2234  curli production assembly/transport component CsgG  28.96 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.734266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2051  curli production assembly/transport component CsgG  28.96 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1205  curli production assembly/transport component CsgG  28.96 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1250  curli production assembly/transport component CsgG  28.96 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.589697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1235  curli production assembly/transport component CsgG  28.96 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.947173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1553  curli production assembly/transport component CsgG  28.41 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.301914  normal  0.209181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  26.52 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  27.65 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  28.42 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  29.02 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  28.5 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  27.46 
 
 		 320 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  27.14 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 401 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  26.92 
 
 		 574 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  25.27 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1993  curli production assembly/transport component CsgG  25 
 
 		 286 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00606032  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2465  curli production assembly/transport component CsgG  26.06 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3472  curli production assembly/transport component CsgG  26.06 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2299  curli production assembly/transport component CsgG  26.06 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3253  curli production assembly/transport component CsgG  22.57 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2419  curli production assembly/transport component CsgG  30.82 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0449  hypothetical protein  27.78 
 
 		 394 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  25.96 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  24.48 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2474  curli production assembly/transport component CsgG  22.86 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0870  curli production assembly/transport component CsgG  21.4 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3152  curli production assembly/transport component CsgG  21.4 
 
 		 268 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0030  Curli production assembly/transport component CsgG  27.91 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  27.81 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1066  curli production assembly/transport component CsgG  24.5 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3685  curli production assembly/transport component CsgG, putative  22.12 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1520  curli production assembly/transport component CsgG  24.66 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301126  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  27.78 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2984  curli production assembly/transport component CsgG  21.79 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1038  curli production assembly/transport component CsgG  21.97 
 
 		 268 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0971  curli production assembly/transport component CsgG  20.19 
 
 		 265 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2588  curli production assembly/transport component CsgG  21.95 
 
 		 312 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1026  Curli production assembly/transport component CsgG  21.63 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3334  curli production assembly/transport component CsgG  21.63 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  25.75 
 
 		 225 aa  42  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>