58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1744 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1744  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 336 aa  674    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0794  SpoOJ regulator  48.39 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2067  TPR repeat-containing protein  51.03 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.885223  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1611  TPR repeat-containing protein  48.68 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1977  TPR repeat-containing protein  41.71 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1496  hypothetical protein  38.84 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1809  hypothetical protein  41.74 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1628  hypothetical protein  41.74 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0502575  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1997  hypothetical protein  40.84 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2026  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  29.05 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  31.39 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  31.39 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  33.02 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  33.02 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  30.33 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  30.33 
 
 		 389 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  23.15 
 
 		 390 aa  52.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  32.04 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1756  tetratricopeptide repeat protein  27.16 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000020151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  28.3 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  28.3 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  29.25 
 
 		 386 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  27.72 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  28.3 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  27.52 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  27.45 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  31.78 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 		 1979 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  26.61 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  26.4 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  27.36 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  22.29 
 
 		 408 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  26.61 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  27.72 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  26.61 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  26.73 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  26.73 
 
 		 386 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  26.73 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  40.82 
 
 		 992 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2384  N-acetylglucosaminyl transferase-like protein  24.66 
 
 		 539 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  26.73 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  29.03 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  21.63 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  21.77 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  21.45 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  30.17 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  31.37 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.85 
 
 		 577 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.85 
 
 		 577 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1404 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.12 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 870 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1069 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>