130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1216 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
408 aa  825    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  36.99 
 
 
388 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  38.4 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  36.53 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  36.9 
 
 
389 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  35.31 
 
 
389 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  35.31 
 
 
389 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  36.52 
 
 
392 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  35.86 
 
 
390 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  31.62 
 
 
389 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  36.22 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  33.16 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  35.25 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  33.16 
 
 
386 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  32.9 
 
 
386 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  35.34 
 
 
390 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  35.34 
 
 
390 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  35.34 
 
 
390 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  32.65 
 
 
386 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  32.49 
 
 
390 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  33.67 
 
 
386 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  35 
 
 
392 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  30.99 
 
 
389 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 
389 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 
389 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 
389 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 
389 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 
389 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 
389 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 
389 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  32.91 
 
 
386 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  33.77 
 
 
389 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  34.6 
 
 
390 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  30.83 
 
 
391 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  31.98 
 
 
386 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  35.08 
 
 
390 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  31.47 
 
 
386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  31.98 
 
 
386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  33.25 
 
 
386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  34.34 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  32.12 
 
 
387 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000160117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  33.17 
 
 
390 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000197215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  34.91 
 
 
391 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  33.17 
 
 
389 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  31.73 
 
 
386 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  31.22 
 
 
386 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  31.57 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  34.2 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 
391 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1756  tetratricopeptide repeat protein  32.23 
 
 
386 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000020151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  31.97 
 
 
386 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 
386 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  30.6 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000146225  hitchhiker  0.0000569887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2641  tetratricopeptide repeat protein  29.34 
 
 
389 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  31.54 
 
 
389 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2367  tetratricopeptide repeat protein  29.59 
 
 
389 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
392 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  32.16 
 
 
389 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215898  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  31.28 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1702  tetratricopeptide repeat protein  29.37 
 
 
389 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000418527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1735  tetratricopeptide repeat protein  29.37 
 
 
389 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  33.01 
 
 
409 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  29.16 
 
 
389 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  31.57 
 
 
389 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000481977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  31.57 
 
 
389 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000487285  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  33.51 
 
 
403 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  34.29 
 
 
425 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  33.25 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  29.97 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  33.25 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  33 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  30.05 
 
 
389 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174406  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 
403 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  0.00000292633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1895  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 
389 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000228715  hitchhiker  4.98218e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  31.95 
 
 
390 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1441  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 
389 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000153911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1622  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 
389 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000649442  decreased coverage  2.66656e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1832  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 
389 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00100254  unclonable  2.05101e-30 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1837  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 
389 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000022719  hitchhiker  0.000343343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4727  tetratricopeptide repeat protein  32.3 
 
 
391 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.841453  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  32.2 
 
 
391 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2138  tetratricopeptide repeat protein  33.24 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00930218  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0959  tetratricopeptide repeat protein  31.11 
 
 
394 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214004  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  31 
 
 
387 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  31 
 
 
387 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3288  tetratricopeptide repeat protein  32.1 
 
 
385 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190691  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0973  tetratricopeptide repeat protein  28.76 
 
 
398 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000517245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1030  tetratricopeptide repeat protein  29.97 
 
 
390 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  30.91 
 
 
385 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  30.91 
 
 
384 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  32.07 
 
 
384 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1786  tetratricopeptide repeat protein  29.47 
 
 
381 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420165 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>