63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1518 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  88.52 
 
 		 240 aa  354  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  83.25 
 
 		 239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  31.93 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  34.58 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  32.2 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  35 
 
 		 340 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2234  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.734266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2051  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1205  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1250  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.589697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1235  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.947173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  32.33 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0591449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  28.38 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  30.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  30.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1553  curli production assembly/transport component CsgG  31.78 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.301914  normal  0.209181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  29.51 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  30.4 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  32.5 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 401 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  28.25 
 
 		 574 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  29.26 
 
 		 321 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3685  curli production assembly/transport component CsgG, putative  23.31 
 
 		 268 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0971  curli production assembly/transport component CsgG  24.53 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3253  curli production assembly/transport component CsgG  23.31 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  28.72 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0643  curli production assembly/transport component CsgG  22.56 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0870  curli production assembly/transport component CsgG  23.31 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3152  curli production assembly/transport component CsgG  23.31 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  28.19 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  28.07 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  23.68 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2857  curli production assembly/transport component CsgG, putative  24.39 
 
 		 261 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.680035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2984  curli production assembly/transport component CsgG  22.42 
 
 		 268 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1993  curli production assembly/transport component CsgG  25.81 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00606032  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1038  curli production assembly/transport component CsgG  23.21 
 
 		 268 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3334  curli production assembly/transport component CsgG  23.35 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1005  curli production assembly/transport component CsgG  23.35 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1026  Curli production assembly/transport component CsgG  23.35 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3472  curli production assembly/transport component CsgG  26.19 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2465  curli production assembly/transport component CsgG  26.19 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2299  curli production assembly/transport component CsgG  26.19 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01506  putative transport protein for curli synthesis  21.68 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2419  curli production assembly/transport component CsgG  29.38 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1276  curli production assembly/transport component CsgG  31.86 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2474  curli production assembly/transport component CsgG  25.4 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  29.8 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1520  curli production assembly/transport component CsgG  27.03 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301126  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2588  curli production assembly/transport component CsgG  22.51 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1820  curli production assembly/transport component CsgG  22.78 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010127  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  29.63 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  28.17 
 
 		 228 aa  42  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1729  curli production assembly/transport component CsgG  25.6 
 
 		 282 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  28.12 
 
 		 324 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0449  hypothetical protein  28.45 
 
 		 394 aa  41.6  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2732  putative curli production assembly/transport component csgg precursor  27.43 
 
 		 313 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>