More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0486 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  100 
 
 		 644 aa  1343    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  61.09 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  59.8 
 
 		 337 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  54.77 
 
 		 338 aa  353  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  54.97 
 
 		 328 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  52.96 
 
 		 326 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  50.16 
 
 		 666 aa  296  9e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  45.57 
 
 		 326 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  41.72 
 
 		 318 aa  266  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  43.03 
 
 		 322 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  42.16 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  42.46 
 
 		 571 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  40.12 
 
 		 345 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  40.91 
 
 		 567 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  35.4 
 
 		 344 aa  206  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  38.08 
 
 		 560 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  34.87 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  34.02 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.92 
 
 		 794 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  34.25 
 
 		 686 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.33 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  34.93 
 
 		 730 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  34.64 
 
 		 627 aa  156  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  35.22 
 
 		 368 aa  150  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  33.51 
 
 		 366 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  33.53 
 
 		 746 aa  147  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  36.63 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  34.22 
 
 		 368 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.78 
 
 		 324 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  35.99 
 
 		 366 aa  144  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  33.15 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  33.15 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  30.83 
 
 		 865 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  33.15 
 
 		 361 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  32.73 
 
 		 269 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.82 
 
 		 323 aa  130  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  29.59 
 
 		 376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  33.01 
 
 		 325 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.67 
 
 		 321 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.76 
 
 		 321 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  31.79 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  32.82 
 
 		 334 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.89 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.48 
 
 		 336 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  33.62 
 
 		 323 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  34.8 
 
 		 325 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.63 
 
 		 321 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  32.98 
 
 		 340 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  33.62 
 
 		 317 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.14 
 
 		 407 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.14 
 
 		 407 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.63 
 
 		 322 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.14 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  32.59 
 
 		 326 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.49 
 
 		 324 aa  108  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.15 
 
 		 312 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  32.62 
 
 		 471 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  29.06 
 
 		 411 aa  104  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  30.51 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  31.58 
 
 		 308 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.58 
 
 		 344 aa  103  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.17 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.18 
 
 		 311 aa  101  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  31.67 
 
 		 391 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  33.96 
 
 		 300 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  31.88 
 
 		 340 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.02 
 
 		 343 aa  99.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.47 
 
 		 1094 aa  98.2  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.4 
 
 		 407 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  29.96 
 
 		 333 aa  96.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 303 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.26 
 
 		 645 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  29.77 
 
 		 434 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.41 
 
 		 409 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  28.4 
 
 		 389 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.7 
 
 		 349 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  29.86 
 
 		 334 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  29.74 
 
 		 420 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  30.18 
 
 		 334 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  30.16 
 
 		 593 aa  91.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  30.15 
 
 		 414 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 		 412 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  31.84 
 
 		 1081 aa  90.9  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.62 
 
 		 422 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  30.99 
 
 		 314 aa  90.9  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.2 
 
 		 426 aa  90.9  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.36 
 
 		 288 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  27.46 
 
 		 393 aa  90.9  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  29.77 
 
 		 414 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  29.77 
 
 		 414 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  30 
 
 		 337 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  30.19 
 
 		 322 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  29.02 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  29.01 
 
 		 400 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  28.52 
 
 		 400 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.37 
 
 		 300 aa  88.2  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  30.77 
 
 		 326 aa  87.8  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  28.27 
 
 		 301 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.13 
 
 		 302 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  26.42 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>