More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0591 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  78.37 
 
 		 247 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  77.59 
 
 		 248 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  74.18 
 
 		 246 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  75.52 
 
 		 246 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  69.29 
 
 		 246 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  67.9 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  67.92 
 
 		 248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  67.5 
 
 		 248 aa  332  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  62.92 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  65.83 
 
 		 249 aa  325  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 242 aa  325  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 		 240 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  66.26 
 
 		 243 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.66 
 
 		 244 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.04 
 
 		 259 aa  321  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  61.83 
 
 		 250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.18 
 
 		 256 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.31 
 
 		 253 aa  318  6e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.31 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  61.51 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.04 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 240 aa  315  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.75 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.61 
 
 		 258 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.61 
 
 		 258 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  57.87 
 
 		 261 aa  314  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  64.32 
 
 		 243 aa  314  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 269 aa  314  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  63.33 
 
 		 244 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  65.98 
 
 		 246 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60.56 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  62.96 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  59.2 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  63.52 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.5 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  62.7 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.16 
 
 		 257 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.83 
 
 		 243 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  59.68 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 242 aa  311  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  62.24 
 
 		 262 aa  311  7.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  63.18 
 
 		 262 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  63.18 
 
 		 262 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.79 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  59.13 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  62.34 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  62.66 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.41 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 245 aa  309  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  60.66 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.07 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.33 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  59.22 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.51 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  62.14 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  61.51 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  59.77 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.02 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  62.08 
 
 		 241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.57 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  63.18 
 
 		 254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.65 
 
 		 257 aa  307  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  307  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.92 
 
 		 258 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.67 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  62.5 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  61.92 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.92 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  57.2 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.5 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  59.58 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  58.04 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  62.08 
 
 		 247 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.08 
 
 		 240 aa  305  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.13 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  61.09 
 
 		 263 aa  305  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.59 
 
 		 265 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  60.17 
 
 		 245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  60.57 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  60.42 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.34 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  60.67 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.73 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  58.73 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60.41 
 
 		 258 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  58.73 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  304  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 		 247 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  62.18 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.84 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 251 aa  304  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>