More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0021 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  100 
 
 
165 aa  339  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  53.21 
 
 
191 aa  162  2e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  45.51 
 
 
233 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0124  NLP/P60 family protein  47.44 
 
 
159 aa  125  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  46.53 
 
 
168 aa  117  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  43.55 
 
 
325 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  38.06 
 
 
173 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  36.88 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.32 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.03 
 
 
273 aa  97.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  37.98 
 
 
230 aa  97.4  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
273 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  6.85507e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  36.97 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  36.67 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
209 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  38.71 
 
 
210 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  39.06 
 
 
209 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  35.33 
 
 
333 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.85 
 
 
424 aa  95.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.25506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  38.76 
 
 
198 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 
327 aa  94.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  38.76 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  35.06 
 
 
160 aa  94  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  36.07 
 
 
226 aa  94  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
175 aa  94  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  36.54 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  37.42 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
208 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
188 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  39.52 
 
 
211 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  43.36 
 
 
188 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
208 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  38.1 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.03 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
207 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
208 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  40 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  38.79 
 
 
382 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  38.84 
 
 
220 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  43.52 
 
 
177 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  40.52 
 
 
364 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  40 
 
 
369 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  40 
 
 
242 aa  91.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40.48 
 
 
181 aa  91.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  36.07 
 
 
228 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  35.83 
 
 
222 aa  91.3  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  37.25 
 
 
154 aa  91.3  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  39.17 
 
 
192 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
524 aa  91.3  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
248 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  36.17 
 
 
181 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  37.06 
 
 
187 aa  90.5  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  38.64 
 
 
190 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  36.17 
 
 
181 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  39.17 
 
 
192 aa  90.5  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
353 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  37.19 
 
 
407 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  37.19 
 
 
407 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  37.19 
 
 
407 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  37.19 
 
 
404 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  37.19 
 
 
404 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  37.19 
 
 
407 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  38.26 
 
 
275 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  37.8 
 
 
273 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.06609e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  37.8 
 
 
273 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.2854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  37.8 
 
 
273 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  38.79 
 
 
407 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  37.8 
 
 
273 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.98 
 
 
235 aa  90.5  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  38.26 
 
 
271 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.02623e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  37.19 
 
 
407 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  37.8 
 
 
273 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  40 
 
 
283 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  37.93 
 
 
258 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  36.6 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  36.6 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  36.6 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  40 
 
 
363 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  36.6 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  40 
 
 
283 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56191e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  36.07 
 
 
224 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  36.6 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  40 
 
 
363 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  40 
 
 
363 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  8.11276e-08 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  37.39 
 
 
256 aa  89  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
354 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  40 
 
 
283 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  32.89 
 
 
162 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  36.13 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  38.52 
 
 
201 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  33.55 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>