More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0808 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  100 
 
 		 409 aa  807    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  63.05 
 
 		 401 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  59.49 
 
 		 391 aa  478  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  56.25 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  58.96 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.39 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  41.15 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  39.74 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  39.35 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  39.3 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  36.55 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.13 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  36.24 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  34.68 
 
 		 408 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  34.09 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.93 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.74 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  29.57 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  31.98 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.79 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  23.16 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  26.72 
 
 		 1347 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  33.54 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  34.44 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  28.35 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  30.42 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  26.86 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25.42 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  34.64 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  27.98 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  32.46 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  26.4 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.57 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  27.04 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.19 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  28.45 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  28.35 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  29.6 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  35.06 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  25.59 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  28.16 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  28.52 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  29.46 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  34.62 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  32.24 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  29.41 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  32.11 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  28.96 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  30.31 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  28.15 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.7 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  29.12 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.7 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  27.72 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  27.62 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  28.81 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.14 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.7 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.8 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.63 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  33.11 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  28.95 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.62 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  29.52 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  25.5 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  37.58 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  27.88 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.15 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  30.4 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  37.24 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  28.34 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.86 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  27.53 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  27.82 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  31.14 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  27.44 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.2 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0449  Sodium:dicarboxylate symporter  23.58 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  26.58 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1033  proton glutamate symport protein  29.08 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.207746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  28.41 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  26 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.6 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  26.08 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  29.23 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.23 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  29.23 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  29.23 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  30.59 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  26.25 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  26.25 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.08 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  28.32 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>