More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0474 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 367 aa  743    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  46.49 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  51.04 
 
 		 442 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  48.97 
 
 		 668 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  43.92 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  49.83 
 
 		 553 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.78 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.75 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  49.65 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  41.13 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 370 aa  242  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  41 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.6 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.8 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  43.55 
 
 		 379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.78 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  41.73 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  44.79 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.45 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  46.69 
 
 		 320 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  42.29 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  39.36 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.72 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  41.12 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  43.13 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  43.13 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  43.21 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  39.74 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  42.51 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 394 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  46.76 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  40.4 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40.53 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.11 
 
 		 375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.24 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  44.48 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  40.73 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  45.8 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.91 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.01 
 
 		 366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  45.88 
 
 		 296 aa  215  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.07 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  39.23 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.07 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  39.95 
 
 		 375 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.8 
 
 		 361 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  40.38 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.21 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  45.52 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  44.14 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  42.7 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.45 
 
 		 369 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  45.33 
 
 		 369 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  42.81 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  43.73 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  51.38 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  41.12 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  39.83 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  39.2 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  37.74 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.24 
 
 		 366 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  43.9 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  38.81 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.98 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  39.47 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  42.18 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  42.18 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  49.51 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  43.84 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  42.71 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>