More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0391 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
522 aa  1063  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 
512 aa  223  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  32.16 
 
 
519 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.86 
 
 
516 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.72 
 
 
524 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.6 
 
 
521 aa  201  2e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  32.44 
 
 
545 aa  202  2e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
521 aa  201  2e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.6 
 
 
521 aa  201  2e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.6 
 
 
521 aa  201  2e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.79 
 
 
521 aa  202  2e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.02 
 
 
524 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  32.13 
 
 
517 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
564 aa  191  3e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 
534 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.64 
 
 
535 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.09 
 
 
525 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 
514 aa  189  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.97 
 
 
524 aa  187  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
497 aa  181  3e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
526 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.9 
 
 
520 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.94 
 
 
531 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 
544 aa  178  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
532 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 
537 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.44 
 
 
510 aa  174  3e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 
544 aa  174  3e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.4 
 
 
505 aa  174  4e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
512 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
512 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
512 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
509 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
516 aa  170  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 
528 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
505 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 
509 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  30.43 
 
 
512 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  30.43 
 
 
512 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.74 
 
 
509 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
516 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  30.22 
 
 
512 aa  168  3e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  30.22 
 
 
512 aa  168  3e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  30.22 
 
 
512 aa  168  3e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.33 
 
 
520 aa  166  1e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
515 aa  165  1e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
510 aa  164  4e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
528 aa  164  5e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
535 aa  163  8e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.07 
 
 
526 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.32073e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  30.65 
 
 
510 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
528 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.82 
 
 
532 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 
521 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.82 
 
 
532 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
512 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  28.21 
 
 
509 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  26.77 
 
 
518 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
515 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 
517 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
519 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
540 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  28.36 
 
 
560 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 
520 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.82 
 
 
532 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  32.29 
 
 
532 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
568 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.18 
 
 
546 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.75897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  29.66 
 
 
521 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 
548 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
520 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 
544 aa  157  5e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.98 
 
 
512 aa  157  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.05 
 
 
538 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
544 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
522 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 
528 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
595 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.98 
 
 
512 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 
522 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
535 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.78 
 
 
512 aa  154  3e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.78 
 
 
512 aa  154  3e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.6 
 
 
525 aa  154  3e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
532 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
520 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.78 
 
 
512 aa  154  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
512 aa  154  6e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  25.8 
 
 
538 aa  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.8 
 
 
524 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 
517 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 
512 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 
532 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
539 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.25789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.18 
 
 
520 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.78 
 
 
512 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.69 
 
 
493 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
512 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 
518 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.47 
 
 
541 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>