More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1122 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  76.38 
 
 		 471 aa  718    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  76.86 
 
 		 507 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  80.04 
 
 		 484 aa  748    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  100 
 
 		 482 aa  949    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  78.56 
 
 		 487 aa  760    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  48.89 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  31.79 
 
 		 489 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  31.79 
 
 		 489 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  31.79 
 
 		 489 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  31.58 
 
 		 489 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 475 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  28.84 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.36 
 
 		 480 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  28.67 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  28.67 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  28.44 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.75 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.75 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.72 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.75 
 
 		 468 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.75 
 
 		 468 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.75 
 
 		 468 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.27 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  27.45 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.54 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.97 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  27.7 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.22 
 
 		 464 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  26.77 
 
 		 458 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  28.72 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25.53 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  24.25 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  20.65 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  25.37 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  24.52 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  23.57 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  26.17 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  25.51 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  26.58 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  25.83 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.29 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  26.92 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  20.78 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  21.9 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  23.64 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  22.43 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  23.64 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  23.34 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>