141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2107 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  100 
 
 
217 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  100 
 
 
217 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  35.94 
 
 
223 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  28.99 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  25.38 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  32.24 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  32.24 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  25.65 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  28.22 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  27.88 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  28.21 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  25.91 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0936  phage integrase family protein  34.82 
 
 
168 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0566684  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  28.76 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  27.63 
 
 
399 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  25.49 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  28.93 
 
 
399 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  23.78 
 
 
182 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  24.84 
 
 
188 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  24.38 
 
 
361 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  24.38 
 
 
361 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  24.38 
 
 
361 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  29.09 
 
 
182 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  25.5 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  24.38 
 
 
361 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  24.38 
 
 
361 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  24.38 
 
 
361 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  24.38 
 
 
361 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  24.84 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  24.18 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  30.19 
 
 
328 aa  50.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.41 
 
 
309 aa  50.1  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  25.97 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  22.51 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  27.87 
 
 
401 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  24.84 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  21.58 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  26.5 
 
 
399 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  25.49 
 
 
415 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  25.49 
 
 
415 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.95 
 
 
180 aa  49.3  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  23.13 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25.64 
 
 
400 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  25.49 
 
 
399 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.49 
 
 
399 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  26.9 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  24.7 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  20.53 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  27.39 
 
 
283 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  25.73 
 
 
309 aa  48.5  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.62 
 
 
467 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  29.41 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  24.03 
 
 
400 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  26.67 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  27.81 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  23.53 
 
 
188 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  24.42 
 
 
305 aa  47  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  33.33 
 
 
387 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  30.43 
 
 
197 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  26.83 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  21.58 
 
 
207 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  26.67 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  27.71 
 
 
218 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  23.53 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  21.05 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  31.07 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  22.11 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  28.48 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  28.48 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  28.48 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  34.12 
 
 
361 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  29.3 
 
 
401 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  27.22 
 
 
602 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  27.05 
 
 
412 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  22.11 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  24.66 
 
 
314 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 
305 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  21.58 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  22.11 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  24.24 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  23.68 
 
 
400 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  24.28 
 
 
180 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  22.63 
 
 
209 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  27.78 
 
 
400 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  24.68 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
339 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  27.78 
 
 
400 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.9 
 
 
290 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  24.68 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.75 
 
 
305 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  23.56 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  24.08 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  23.17 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  23.56 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  23.56 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  23.68 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.52 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>