More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0782 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  83.14 
 
 
427 aa  713  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  76 
 
 
427 aa  674  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  73.27 
 
 
411 aa  634  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  79.95 
 
 
426 aa  673  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  73.06 
 
 
431 aa  639  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  75.37 
 
 
424 aa  655  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  73.76 
 
 
411 aa  636  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
425 aa  879  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
425 aa  879  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  78.15 
 
 
427 aa  699  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  76.36 
 
 
425 aa  678  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  79.81 
 
 
427 aa  686  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 
423 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  72.4 
 
 
429 aa  630  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  69.6 
 
 
423 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 
423 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  72.52 
 
 
416 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  69.73 
 
 
423 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.11 
 
 
415 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
418 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 
413 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 
415 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 
420 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 
415 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
412 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
411 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 
412 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
412 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
417 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
412 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
419 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
432 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 
431 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 
415 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
414 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 
437 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 
413 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 
415 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.67671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
412 aa  524  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
412 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
415 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 
429 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 
427 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 
416 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 
439 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
415 aa  516  1e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 
422 aa  515  1e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
431 aa  516  1e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
438 aa  515  1e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 
431 aa  515  1e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 
432 aa  515  1e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 
415 aa  516  1e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
438 aa  517  1e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 
410 aa  516  1e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 
432 aa  517  1e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
431 aa  516  1e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
431 aa  517  1e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 
417 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
416 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 
410 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
424 aa  511  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 
414 aa  508  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 
416 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 
417 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 
433 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 
427 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 
417 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 
412 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 
427 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 
419 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 
424 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 
417 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 
412 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
431 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 
417 aa  506  1e-142  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 
431 aa  505  1e-142  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 
411 aa  506  1e-142  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 
434 aa  506  1e-142  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 
417 aa  505  1e-142  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
417 aa  507  1e-142  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 
423 aa  507  1e-142  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
434 aa  506  1e-142  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
432 aa  506  1e-142  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 
424 aa  505  1e-142  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  59.09 
 
 
438 aa  505  1e-142  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  2.80655e-05  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 
434 aa  506  1e-142  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 
413 aa  504  1e-142  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 
420 aa  506  1e-142  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 
417 aa  504  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 
413 aa  505  1e-142  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 
417 aa  507  1e-142  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 
433 aa  508  1e-142  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
434 aa  506  1e-142  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 
417 aa  507  1e-142  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 
413 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 
417 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
433 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 
415 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  57.43 
 
 
418 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 
417 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>