More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2557 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 484 aa  937    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  64.77 
 
 		 488 aa  549  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  41.47 
 
 		 479 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  41.47 
 
 		 479 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  44.4 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  42.67 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  38.35 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  43.43 
 
 		 495 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  42.49 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 509 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  35.01 
 
 		 516 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  36.73 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  35.4 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  35.98 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  35.98 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  36.81 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  35.79 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 		 527 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  40 
 
 		 497 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  37.64 
 
 		 516 aa  264  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  40.25 
 
 		 486 aa  256  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  36.69 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  39.24 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 		 486 aa  246  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  35.01 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 		 493 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  32.46 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  36.44 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 485 aa  229  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  36.11 
 
 		 504 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  31.92 
 
 		 474 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  38.63 
 
 		 496 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 491 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  39.42 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  35.7 
 
 		 507 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 486 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  28.52 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 507 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 450 aa  90.9  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 497 aa  87.8  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  27.43 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  27.07 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.07 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  29.97 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.2 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  29.19 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.94 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.88 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  24.88 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  24.88 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  24.88 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  24.88 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.88 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>