More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3987 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  100 
 
 		 435 aa  899    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  46.24 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  40.62 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  36.45 
 
 		 480 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.34 
 
 		 568 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  27.67 
 
 		 585 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  26.5 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.24 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  27.73 
 
 		 819 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.26 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.33 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.12 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.37 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.86 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.08 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.11 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  28.31 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.07 
 
 		 686 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.47 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.28 
 
 		 426 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.92 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  26.78 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  24.77 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  24.72 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  25.85 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.34 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  24.78 
 
 		 692 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.32 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  22.32 
 
 		 1005 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  25 
 
 		 470 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  25.11 
 
 		 447 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  27 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  25.75 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  26.42 
 
 		 1084 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  26.82 
 
 		 1060 aa  94  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  24.95 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  26.26 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.83 
 
 		 433 aa  93.2  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  25.23 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  25.21 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.35 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  27.25 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  24.72 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.37 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  24.94 
 
 		 470 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  23.81 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  24.46 
 
 		 438 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  22.72 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.11 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.45 
 
 		 421 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.67 
 
 		 702 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  24.77 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  26.32 
 
 		 1081 aa  87  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  27.34 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  25.47 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.32 
 
 		 432 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  24.89 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.52 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  26.23 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  25.6 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.87 
 
 		 1067 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  27.25 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.38 
 
 		 1065 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  26.23 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  26.23 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.63 
 
 		 1062 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  23.9 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.03 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  25.25 
 
 		 1049 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.75 
 
 		 1069 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.31 
 
 		 1066 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  21.57 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.63 
 
 		 1062 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  23.12 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  25.38 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25.63 
 
 		 1062 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  26.16 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25 
 
 		 1062 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25.13 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.75 
 
 		 1062 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.38 
 
 		 1062 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.38 
 
 		 1062 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.38 
 
 		 1062 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.76 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  25.12 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  23.61 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.71 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  22.51 
 
 		 694 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  22.71 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  22.79 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  25.6 
 
 		 1078 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  23.48 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.35 
 
 		 1059 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  24.65 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.36 
 
 		 1062 aa  77  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.17 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  24.17 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  26.03 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  22.15 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24 
 
 		 1138 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>