More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0736 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.84 
 
 		 360 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.84 
 
 		 360 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  52.54 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  59.18 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  57.66 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  57.66 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.76 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  50.78 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  64.04 
 
 		 358 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  64.04 
 
 		 324 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  56.19 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  59.34 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  58.24 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  58.76 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 170 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  53.21 
 
 		 261 aa  117  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  57.58 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  46.83 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 249 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  52.73 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  53.47 
 
 		 199 aa  114  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 342 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  60.23 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  48.6 
 
 		 339 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  56 
 
 		 371 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  54 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  54.21 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 186 aa  113  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 367 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  64.63 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  53.45 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 221 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  54 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 198 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 179 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  44.8 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  61.36 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  51.79 
 
 		 335 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0601  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 238 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 238 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0622  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.717997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 213 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  51.85 
 
 		 206 aa  107  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  43.7 
 
 		 342 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  43.7 
 
 		 342 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 275 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 275 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  44.86 
 
 		 318 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 266 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  51.85 
 
 		 206 aa  106  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.95 
 
 		 211 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 323 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 303 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  53 
 
 		 278 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  42.61 
 
 		 269 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  58.75 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  53.26 
 
 		 239 aa  106  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 262 aa  106  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 322 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 211 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  49 
 
 		 254 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 285 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 211 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 211 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 242 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  48.96 
 
 		 267 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 242 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>