More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2121 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.7 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 231 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.44 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.89 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 230 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  51.56 
 
 		 227 aa  221  7e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2327  two-component response regulator  52.34 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  42.54 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.78 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4937  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  41.23 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.85 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.6 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  43.72 
 
 		 238 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  43.04 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.48 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  39.73 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.78 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 232 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  40.33 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.39 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  41.03 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.92 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>