278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0518 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  100 
 
 		 356 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  62.71 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  62.22 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  63.03 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  50 
 
 		 358 aa  349  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  50.67 
 
 		 402 aa  345  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  50.31 
 
 		 352 aa  332  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  40.33 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  45.83 
 
 		 378 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  37.41 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  43.44 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  35.6 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  38.58 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  41.6 
 
 		 350 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  40.43 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  36.48 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  40.96 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  35.84 
 
 		 620 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  49.38 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  46.63 
 
 		 461 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  45.11 
 
 		 475 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  40.53 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  51.56 
 
 		 474 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  51.76 
 
 		 509 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  38.81 
 
 		 491 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  38.16 
 
 		 501 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  38.16 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  37.85 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  37.67 
 
 		 511 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  37.67 
 
 		 513 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  37.04 
 
 		 503 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  39.69 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  49.67 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  36.84 
 
 		 495 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  27.39 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  29.81 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  28.57 
 
 		 308 aa  99.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  27.04 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  27.16 
 
 		 714 aa  93.2  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  26.82 
 
 		 316 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  27 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  21.69 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  26.95 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  21.69 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.09 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  25.17 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  24.38 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  27.01 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  23.81 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  25.26 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  25.26 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  27.27 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  25.88 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  24.91 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  27.3 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  24.16 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  25.59 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  24.91 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  26.67 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  24.17 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  23.45 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  25.08 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  26.69 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  25.5 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  24.92 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  25.96 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  26.36 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  24.14 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  25.48 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  22.86 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  25.26 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  26.33 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  25.45 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  24.46 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.36 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.49 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  26.79 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  25.78 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  26.87 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  25.78 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  26.76 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  24.45 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  24.45 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  24.45 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  27.11 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  25.14 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  23.86 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  24.22 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  23.96 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  22.78 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.66 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  24.91 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  24.16 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>