138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1878 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  100 
 
 
364 aa  741    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  66.09 
 
 
357 aa  474  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  63.98 
 
 
366 aa  461  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  59.26 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  53.98 
 
 
365 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  51.66 
 
 
366 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  50.14 
 
 
362 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  53.67 
 
 
358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  51.54 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  53.5 
 
 
370 aa  342  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  51.73 
 
 
357 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  50.93 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  50.47 
 
 
321 aa  319  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  49.24 
 
 
347 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  47.45 
 
 
346 aa  278  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  49.86 
 
 
375 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  47.76 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  39.94 
 
 
346 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  39.7 
 
 
341 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  30.26 
 
 
477 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  33.44 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  30.09 
 
 
366 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  26.63 
 
 
573 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  25.76 
 
 
545 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  27.57 
 
 
361 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  24.92 
 
 
498 aa  96.7  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  25.62 
 
 
535 aa  94.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  25.89 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25.6 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  22.57 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  27.64 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  28.52 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.92 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
760 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  25.42 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  25.88 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  27.38 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  28.28 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  27.86 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  22.19 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  24.25 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  23.8 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  26.55 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  24.58 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  27.01 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  27.2 
 
 
448 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  26.04 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  24.92 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  36.73 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.3 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  26.27 
 
 
469 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.18 
 
 
466 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.18 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  24.71 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25.32 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  24.02 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  24.19 
 
 
380 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  32.22 
 
 
452 aa  63.5  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  23.92 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  26.5 
 
 
360 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  24.84 
 
 
413 aa  62.8  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  23.18 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  37.35 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  31.46 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  28.04 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  37.18 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  32.26 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  37.18 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  27.56 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  23.23 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  26.01 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  34.48 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  34.83 
 
 
418 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  20.75 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  22.93 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  34.57 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  30.85 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  30.85 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  30.85 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  24.02 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  27.73 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  25.95 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  24.22 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  25.95 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  32.38 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  25.31 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  25.95 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  31.03 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  28.39 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  23.67 
 
 
409 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  37.04 
 
 
415 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  37.04 
 
 
418 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  32.38 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  23.62 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  32.38 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  24.83 
 
 
360 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  32.18 
 
 
464 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  37.18 
 
 
427 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>