More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08900 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  100 
 
 
357 aa  728  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  8.7001e-05  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  81.64 
 
 
352 aa  595  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  2.4235e-11 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  76.84 
 
 
352 aa  569  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  65.55 
 
 
355 aa  466  1e-130  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 
357 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
356 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 
360 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.61971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
355 aa  368  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
355 aa  368  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 
355 aa  368  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
355 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.00734e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.02201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 
360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.99175e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 
360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.28118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 
358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.10571e-09  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.83 
 
 
357 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.16881e-11  hitchhiker  3.05481e-10 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
358 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.04378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
358 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.75 
 
 
355 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
358 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.28302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
355 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.88952e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
358 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.02063e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
355 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.69919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 
355 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
358 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38678e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 
360 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 
361 aa  364  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
361 aa  363  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
362 aa  363  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  53.94 
 
 
356 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
356 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 
355 aa  360  3e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
357 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 
356 aa  358  1e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.3 
 
 
359 aa  358  1e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.31 
 
 
372 aa  357  2e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  50 
 
 
358 aa  357  2e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 
358 aa  357  2e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.77535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 
355 aa  356  3e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  53.97 
 
 
359 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
358 aa  355  6e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.01474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
357 aa  355  7e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  50 
 
 
355 aa  355  7e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 
355 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 
354 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
355 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
370 aa  353  3e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
359 aa  352  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 
355 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 
355 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.98 
 
 
355 aa  351  9e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
355 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
361 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
370 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
370 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
355 aa  349  4e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 
355 aa  348  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 
361 aa  348  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.4 
 
 
362 aa  347  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.01734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 
355 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 
358 aa  346  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
363 aa  346  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 
360 aa  345  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 
362 aa  345  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 
357 aa  345  7e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
359 aa  344  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
356 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  9.63425e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  51.89 
 
 
361 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 
356 aa  344  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.57905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  53.94 
 
 
364 aa  343  3e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 
362 aa  342  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 
362 aa  342  5e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 
357 aa  342  6e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 
353 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 
360 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 
367 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
360 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
360 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  48.43 
 
 
360 aa  339  3e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 
354 aa  340  3e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
358 aa  340  3e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.76457e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 
363 aa  339  4e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 
357 aa  339  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  53.77 
 
 
362 aa  338  6e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 
360 aa  338  6e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 
363 aa  338  8e-92  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  48.15 
 
 
360 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 
357 aa  337  1e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.31 
 
 
363 aa  337  1e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  53.46 
 
 
362 aa  337  2e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 
357 aa  336  3e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  52.52 
 
 
363 aa  337  3e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
358 aa  336  3e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.42042e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  50.69 
 
 
359 aa  336  3e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
360 aa  336  3e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  51.72 
 
 
362 aa  336  3e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 
363 aa  336  3e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  49 
 
 
360 aa  336  4e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>