More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0067 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  100 
 
 		 385 aa  788    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  27.44 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  26.63 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  26.63 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  26.63 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  26.29 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  28.03 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  25.33 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  27.38 
 
 		 519 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  26.36 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  29.27 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  25.28 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  25 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  25 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  25 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.35 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  24.63 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  24.63 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  24.63 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  24.15 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  24.63 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  24.86 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  22.85 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  22.85 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  22.85 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.51 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.12 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  32.53 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.12 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  22.71 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  23.65 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  23.65 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  23.65 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.69 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  22.69 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  32.84 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.31 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.68 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  22.92 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  29.45 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.78 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  22.95 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  23.84 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.84 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  23.53 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  21.85 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  25.07 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.29 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  22.81 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  23.95 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.95 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.93 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  23.01 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.7 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.42 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  24.29 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.42 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  22.99 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.23 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  25.99 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  25.07 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  23.35 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  24.39 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.15 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  26.26 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  25.35 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  25.3 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  25.22 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  23.36 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.16 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  35.53 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.16 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  20.77 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.88 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  23.31 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>