37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4011 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  100 
 
 		 433 aa  895    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  32.47 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  30.83 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  26.77 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  26.67 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  27.06 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  48.42 
 
 		 147 aa  103  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  25.82 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  26.93 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  23.85 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  23.51 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  23.75 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  31.58 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  25.48 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  24.76 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  29.79 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  23.08 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  23.08 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  25.14 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  23.83 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  21.19 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  24.65 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  24.82 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  23.48 
 
 		 296 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  24.2 
 
 		 357 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  23.35 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  23.35 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  23.35 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  22.16 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  23.98 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  22.16 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.51 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  25.17 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>